Potex-virus

Potex-virus
EM- opptak av potetvirus X - virioner
Systematikk
Klassifisering : Virus Rike : Riboviria Empire : Orthornavirae Phylum : Kitrinoviricota Klasse : Alsuviricetes Bestilling : Tymovirales Familie : Alphaflexiviridae Sjanger : Potex-virus
Taksonomiske egenskaper
Genom : ss (+) RNA Baltimore : Gruppe 4 Symmetri : spiralformet Deksel : Nei
Vitenskapelig navn
Potex-virus
Venstre
NCBI  taksonomi: 12176 ViralZone ( ExPASy , SIB): 272 ICTV taxon historie: 201902192

Potexvirus er en slekt av virus i rekkefølgen Tymovirales , i familien Alphaflexiviridae . Planter fungerersom naturlige verter . Foreløpig (per april 2021) er det 38 arter (arter) i denne slekten, inkludert typen arter Potetvirus X (en. Potatvirus X ). Blant sykdommene som er assosiert med denne sjangeren inkluderer mosaikk - og ringspot symptomer.

Det generiske navnet er avledet av det engelske navnet på typen Arten Pot ato Virus X og slutten - virus for virusgenrer.

morfologi

De virioner (viruspartikler) i slekten Potexvirus ikke er innhyllet , filamentøse (trådliknende) fleksibel med spiralformet symmetri. Lengden kan variere mye, mellom 470 og 1000  nm (nanometer) eller mer; diameteren er omtrent 12-13 nm. Den stigning av skruelinjen er 3,3 til 3,7 nm. Den kapsid består av 1000-1500 kopier ( monomerer ) av kapsid-protein (CP) med 8-9 monomerene pr omdreining.

Genom og proteom

Den genomet er unsegmented (monopartite), lineær, og består av en enkelt- trådet RNA -molekyl av positiv polaritet med en lengde på 5.9-7.0  kb (kilobaser) lang. Den 5 'ende har en dekselkonstruksjon , den 3'-ende er polyadenylert . Genomet koder for 5 proteiner . Fra 5'-enden til 3'-enden er disse proteinene:

• viral replikasjonsprotein med et mRNA-capping enzymdomene etc.
• den RNA-avhengige RNA-polymerase
• trippelgenblokken (TGB), tre delvis overlappende åpne leserammer ( ORFer )
• den kapsidproteinet

Ved oversettelse ( oversettelse ) av det genomiske RNA produseres en viral RNA-polymerase . Dette produserer igjen en negativsträngiges mal ( mal ) genereres fra et sett med subgenomiske RNA (sgRNA) som til slutt vil bli oversatt til virale proteiner:

• 5'-enden er omtrent 80 nukleotider lang, og vanligvis begynner med sekvensen G A AAA.
• Virus-RNA-polymerase med ca. ~ 150  kDa (KiloDalton) har, i tillegg til sin RNA-polymeraseaktivitet, metyltransferase- og RNA- helikaseaktiviteter .
• TGB-proteinene er blant slektene Allexivirus , Carla-virus , Foveavirus , furovirus , Hordeivirus , Pecluvirus , Pomovirus og potexvirus bevart . Deres eksakte funksjoner er gjenstand for aktuell forskning.

• TGB1 (molekylvekt 23 kDa) er et multifunksjonelt protein. Den har RNA-helikaseaktivitet og ser ut til å være involvert (som et bevegelsesprotein ) i bevegelse fra celle til celle.
• TGB2 (molekylvekt 11 kDa) og TGB3 (molekylvekt 10 kDa) assosieres med endoplasmatisk retikulum .

• Kapsidproteinet har en molekylvekt på ca. 25 kDa.
• Det utranslaterte området i 3'-enden ( 3'UTR ) er ca. 100 nukleotider lange.

Reproduksjonssyklus

Virusreplikasjon finner sted i cytoplasmaet til vertscellene . Den følger modellen (standard) for replikering av (+) ssRNA-virus (enkeltstrengede RNA-virus med positiv polaritet). Den transkripsjon følger mønsteret for (+) ssRNA virus. Den oversettelse utføres ved utett scanning [en] . Overføringsbanene er vektor og mekaniske.

Verter

Alle kjente verter smitter forskjellige blomstrende planter ( Magnoliopsida ).

fordeling

Representanter for slekten Potexvirus distribueres over hele verden.

Systematikk

Bamboo infisert med bambus mosaikk virus (BAMV)		Segmenter av spiralformede partikler av Lily Virus X (LVX)

Blad av en orkide infisert med Cymbidium Mosaic Virus (CymMV)		Snøfjær hosta ( Hosta undulata ) infisert med hosta virus X (HVX)

Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus (ICTV) har per april 2020 i slekten potexvirus bekreftet følgende typer (arter):

• Arter: Actinidia virus X (ACVX, alias Plantain virus X )
• Arter: Alliumvirus X
• Arter: Alstroemeria-virus X (AlsVX)
• Arter: Alternanthera mosaic virus (AltMV)
• Arter: Aspargesvirus 3 (AV-3, de. Aspargesvirus 3 )
• Arter: Bamboo mosaikk virus (BaMV, tysk bambus mosaikk virus )
• Arter: Kaktusvirus X (CVX)
• Arter: Cassava common mosaic virus (CsCMV)
• Arter: Cassava virus X (CsVX, også CsXV)
• Arter: Kløvergult mosaikkvirus (ClYMV)
• Arter: Cymbidium mosaic virus (. CymMV, de Cymbidium- Mosaikvirus , se Cymbidium §Krankheiten og skadedyr )
• Arter: Foxtail mosaic virus (FoMV)
• Arter: Hosta-virus X (HVX, de. Funkienvirus X , se Funkien § Skadedyr og sykdommer )
• Arter: Hydrangea ringspot virus (HRSV)
• Arter: Lagenaria mild mosaikkvirus (LaMMoV)
• Arter: Salatvirus X (LMV)
• Arter: Liljevirus X (LVX, de. Lilienvirus X )
• Arter: Malva-mosaikkvirus
• Arter: Myntevirus X (MVX)

Påskeliljer med " fargebryt " - et symptom på påskeliljemosaikkviruset (NMV) (A, B) og en normal blomst (C)		EM- opptak av virioner av narcissus mosaic virus (NMV)

• Arter: Narcissus mosaic virus (NMV, de. Narcissus mosaic virus )
• Arter: Nerine virus X (NVX)
• Arter: Opuntia-virus X
• Arter: Papaya mosaic virus (PapMV)
• Arter: Pepino mosaic virus (PepMV)
• Arter: Phaius virus X (PhVX)
• Arter: Pitaya virus X (PiVX)
• Arter: Plantago asiatica mosaic virus (PlAMV)
• Arter: Plantain virus X (PIVX)
• Arter: Potet aucuba mosaikkvirus (. PAMV, de potet Aucubamosaikvirus )
• Arter: Potetvirus X ( PVX , de. Potetvirus X , type)
• Arter: Schlumbergera virus X (SchVX)
• Arter: Jordbær mild gulkantvirus (SMYEV0)
• Arter: Tamus red mosaic virus (TRMV)
• Arter: Tulipan virus X (TVX, de : Tulip virus X )
• Arter: Vaniljevirus X (VVX)
• Arter: Hvitkløvermosaikkvirus (WClMV)
• Arter: Yam virus X (YVX)
• Arter: Zygocactus virus X (ZVX)

Andre foreslåtte medlemmer er:

• Arter: " Cnidium virus X " (CnVX)
• Arter: " Papaya virus X "

Individuelle bevis

1. ↑ ^{a b c d e f} ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , Ny MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2018b-utgivelsen, mars 2020 (MSL # 35)
2. ↑ ^{a b c d} Viral Zone . EXPASy. Hentet 26. april 2021.
3. ^ F. Côté, C. Paré, N. Majeau, MN Bolduc, É. Leblanc, MG Bergeron, MG Bernardy, D. Leclerc: Nukleotidsekvens og fylogenetisk analyse av et nytt potexvirus: Malva Mosaic Virus . I: Infeksjon, genetikk og evolusjon . 8, nr. 1, 2008, s. 83-93. doi : 10.1016 / j.meegid.2007.10.006 . PMID 18054524 .
4. Hamm John Hammond, Ian Adams, Aimee R. Fowkes, Sam McGreig, Marleen Botermans, Joanieke JA van Oorspronk, Marcel Westenberg, Martin Verbeek, Annette M. Dullemans, Christina CMM Stijger, Arnaud G. Blouin, Sebastien Massart, Kris De Jonghe, Maaike Heyneman, John A. Walsh, Adrian Fox: Sekvensanalyse av 43 år gamle prøver av Plantago lanceolata viser at Plantain virus X er synonymt med Actinidia virus X og er mye distribuert . I: Wiley-Blackwell (red.): Plantepatologi . 7. november 2020, ISSN  0032-0862 . doi : 10.1111 / ppa.13310 .
5. ^ R. A. C. Jones, Renate Koenig, D. E. Lesemann: Pepino mosaic virus , et nytt potexvirus fra pepino ( Solanum muricatum ) . I: Association of Applied Biologists / Wiley-Blackwell (red.): Annals of Applied Biology . 94, nr. 1, 1980, ISSN 0003-4746 , s. 61-68. doi : 10.1111 / j.1744-7348.1980.tb03896.x .  
6. ↑ NCBI: Cnidium-virus X / art
7. Hon H. Honma, D. Tsushima, H. Kawakami, N. Fujihara, T. Tsusaka, M. Kawashimo, T. Nishimura, S. Fuji: Komplett nukleotidsekvens av et nytt potexvirus, 'Cnidium virus X', isolert fra Cnidium officinale i Japan , i: Archives of Virology, bind 164, s. 1931-1935, 22. april 2019, doi: 10.1007 / s00705-019-04261-6
8. ↑ NCBI: Papaya virus X (art)

weblenker

• Slekt: Potexvirus - Alphaflexiviridae - RNA-vira med positiv sans . Hentet 13. november 2020.
• Viral sone: Potex-virus