Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus

Den internasjonale komiteen for virataksonomi ( ICTV , International Committee for the Taxonomy of Viruses ) har vært et organ på for tiden rundt 500 virologer i International Union of Microbiological Societies siden 1971 . Det fungerer på standardisering og organisering av taksonomiske navn på virus , viroider , virusoider , prioner og retrotransposoner . Forløperen til ICTV var den internasjonale komiteen for virusnomenklatur (ICNV), som dukket opp i anledning den 9. internasjonale kongressen for mikrobiologi i Moskva i 1966 fra den foreløpige komiteen for virusnomenklaturen til den internasjonale foreningen for mikrobiologiske samfunn ( IAMS), som hadde eksistert siden 1963 .

aktivitet

Arbeidet til dette uavhengige organet kreves når et nytt virus blir oppdaget og det tildeles et internasjonalt gyldig navn. I tillegg er ICTV opptatt av systematisk omdøping av virusgrupper og deres inndeling i slekter, familier og ordrer. Rapportene og spesifikasjonene til ICTV er bindende for den vitenskapelige betegnelsen og utgjør dermed den offisielle virustaksonomien .

ICTV-taksonomien inkluderer for tiden tre ordrer, 73 familier, 9 underfamilier, 287 slekter og mer enn 5450 virus i mer enn 1950 arter.

Arbeidet til ICTV er ikke uten kritikere, så ICTVs forsøk på å fortsette å utveksle vanlige navn i publikasjoner (for det meste oppkalt etter oppdagere eller steder) mot systematiske navn, f.eks. B. Humant herpesvirus 4 ( Epstein-Barr-virus ) eller HHV 3 ( varicella zoster-virus ). Et nylig eksempel på en navnekonflikt var SARS- viruset, som ble isolert nesten samtidig i Asia, Amerika og Europa fra pasienter med sykdommen med samme navn i 2003 . Opprinnelig sirkulerte forskjellige navn avhengig av oppdageren. Navnet "SARS-CoV" tildelt av ICTV inkluderer på den ene siden sykdommen (SARS), virusfamilien (Co) Coronaviridae og "V" for virus.

I år 1986 var den konsekvente navngivningen av et spesielt virus av stor betydning: fra de synonyme begrepene: LAV, HTLV-III, ARV, og en rekke individuelle navn, bestemte ICTV taksen HIV for "Human Immunodeficiency Virus" (Human Immun Weakness virus).

ICTV-mål

De offisielle målene for ICTV er (i henhold til gyldig 8. rapport fra ICTV 2004 ):

  • Utvikling av en internasjonalt anerkjent taksonomi
  • Utvikling av allment aksepterte navn for taxa av virus og subvirale patogener
  • Offentliggjøring av taksonomiske beslutninger
  • Utarbeidelse av artslister og en taksonomisk internettdatabase (ICTVdB)

Taksonomiske regler

Den virologiske nomenklaturen bør i prinsippet ha en viss forståelig stabilitet, og unngå forvirring og tvetydighet i taxa og unngå unødvendig oppretting av navn. Samtidig bør taksonomien representere fylogenetiske forhold så korrekt som mulig. De første grunnleggende reglene (spesielt avgang fra det bakteriologiske systemet), der alle virus skal registreres, ble utarbeidet i 1975. Tidligere var det forskjellige taksonomiske systemer for bakteriofager, plantevirus og dyrevirus.

Det engelske navnet gjelder det internasjonale navnet på en art. Egennavn og nummerering i forbindelse med enkeltbokstaver skal unngås. Slekter har enden -virus , underfamilier -virinae , familier -viridae og ordrer -virales . Taxa skal alltid skrives i kursiv (med unntak av ordrer) og med riktig slutt.

I prinsippet bør reglene for virus også brukes på klassifiseringen av subvirale patogener. Artenavnet på viroider bør ende på -viroid , deres slekter -viroid , underfamilier -viroinae og familier -viroidae . Retrotransposons regnes som virus for taksonomi; en relativt gratis taksonomi er tillatt for satellitter og prioner inntil videre funn tillater en klar taksonomi.

Taksonomi og fylogeni

På grunn av mangfoldet av virus og kontroversene om deres evolusjon , representerer ikke taksonomien genealogiske linjer. Synet på at virus stammer fra veldig forskjellige systemer av nukleinsyrer og proteiner, fra eukaryote og prokaryote celler, tillater også en klar klassifisering i evolusjonære- biologiske klare forhold begrenset til. Virustaksonomien er derfor ikke monofyletisk . Dette er en av grunnene til at taksonomien vanligvis bryter av på familienivå og sjelden rekkefølgen.

Selv taksonomisk viktige kriterier som genomet eller tilstedeværelsen av et skall er ikke kriterier for å akseptere eller ekskludere forhold. Anskaffelse eller fornyet tap av et skall når verten forandrer seg, kan for eksempel være genetisk mulig, akkurat som emballering av forskjellige nukleinsyrer under replikasjon har ført til fremveksten av RNA-virus fra DNA-virus og omvendt (eksempel: representanter for Hepadnaviridae- familien , ved innpakning av DNA-stadiet til et originalt RNA-virus kan antas).

Trivia

8. mai 2015 publiserte Verdens helseorganisasjon (WHO) en uttalelse der retningslinjer for navn på nyoppdagede smittsomme sykdommer og deres patogener ble formulert. I følge WHO-informasjon har noen navngivninger ført til utilsiktede negative konsekvenser tidligere, for eksempel ved å provosere uberettiget trafikk- og reisehindringer, restriksjoner på handel eller uberettiget slakting av husdyr. Medlemmer av visse etniske eller religiøse grupper ville ha lidd ulemper som et resultat. Midtøsten respiratorisk syndrom (MERS) og " svineinfluensa " ble nevnt som eksempler . Navngivning av nye sykdommer og smittsomme stoffer må derfor gjøres med stor forsiktighet, siden trivielle navn som er innført er vanskelig å fjerne fra offentlig bruk. Virusnavn, hvis de er avledet av sykdommene de forårsaker, bør være beskrivende og beskrive sykdommen i generiske termer (f.eks. Respiratorisk, nevrologisk, diaré ...), kombinert med egnede egenskaper (alvorlig, progressiv, ung, vinterlig ... ). På den annen side bør man unngå uttrykk (alle følgende eksempler fra WHO-erklæringen) som refererer til geografiske forhold (f.eks. Midtøsten respiratorisk syndrom , spansk influensa , riftdallfeber ), samt uttrykk med personlige navn (f.eks. Creutzfeldt-Jakob Sykdom , Chagas sykdom ), dyrearter eller matnavn (f.eks. Svineinfluensa, fugleinfluensa , apekopper ) eller kulturelle, etniske, populasjons- eller yrkesuttrykk (f.eks. Legionærsykdom ). Uttrykk som uhensiktsmessig kan utløse frykt ("ukjent", "dødelig", "epidemi") bør også unngås.

litteratur

  • CM Fauquet, MA Mayo, J. Maniloff, U. Desselberger, LA Ball (Red.): Åttende rapport fra Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus. Elsevier Academic Press, London / San Diego 2005, ISBN 0-12-249951-4 .
  • Andrew MQ King, Michael J. Adams, Eric B. Carstens, Elliot J. Lefkowitz, et al. (Red.): Virustaksonomi - Klassifisering og nomenklatur for virus (= International Committee on Taxonomy of Virus [Ed.]: ICTV Reports . 9. rapport). Elsevier - Academic Press, Amsterdam / Boston / Heidelberg / London / New York / Oxford / Paris / San Diego / San Francisco / Singapore / Sydney / Tokyo 2012, ISBN 978-0-12-384684-6 (engelsk, 1344 s., begrenset forhåndsvisning i Google Book-søk).
  • Forfatterne av den niende ICTV-rapporten: Virustaksonomi - Klassifisering og nomenklatur for virus. Online utgave. I: ICTV-rapporter . International Committee on Taxonomy of Viruses, 2011, åpnet 12. juni 2020 (engelsk, parallell arkivert 2. april 2019 på web.archive.org .).

weblenker

Individuelle bevis

  1. ^ Frank Fenner : Nomenklatur og klassifisering av virus - Den internasjonale komiteen for nomenklatur for virus . I: Journal of General Virology . teip 13 , nr. 2 , 1. november 1971, doi : 10.1099 / 0022-1317-13-2-iv (engelsk).
  2. ^ Frank Fenner: Klassifisering og nomenklatur for virus. Sammendrag av resultatene fra møter i Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus i Madrid, september 1975 . J. General Virol. (1976) 31 (3): s. 463-70 PMID 819628
  3. ^ WHO gir beste praksis for å navngi nye smittsomme sykdommer hos mennesker. Verdens helseorganisasjon, 8. mai 2015, åpnet 6. februar 2020 .