EXPASy

ExPASy ("Expert Protein Analysis System", på tysk "Scientific Protein Analysis System") er en portal for bioinformatikkverktøy og biokjemi databaser , som ble oppfunnet og administrert av Amos Bairoch fra Swiss Institute for Bioinformatics (SIB) . I tillegg til proteindatabasen Swiss Prot , er ExPASy en server som tilbyr en rekke bioinformatikkverktøy, vitenskapelige kilder og andre databaser og programvareverktøy i nesten alle forskjellige områder innen biovitenskap . ExPASy dekker områdene proteomikk , genetikk og fylogenese/ Systembiologi , evolusjon , populasjonsgenetikk , transkriptomi , legemiddeldesign og biofysikk . Det er en av de viktigste serverne for proteinanalyse , med 53 verktøy og 25 databaser. De enkelte områdene (databaser, bioinformatikkverktøy osv.) Administreres og behandles sentralt av 20 forskjellige SIB-grupper, som er lokalisert over hele Sveits . I tillegg er eksterne kilder koblet sammen og integrert i ExPASy. I tillegg er en søkefunksjon integrert i portalen, som lar deg søke i utvalgte kilder på portalen. ExPASy-serveren er kvalitetskontrollert, i motsetning til for eksempel data på Pubmed fra National Center for Biotechnology Information (NCBI). Nettstedet er utformet på en slik måte at både eksperter og personer som bare av og til bruker bioinformatiske databaser og verktøy kan finne veien rundt.

Fra etableringen av ExPASy-portalen 1. august 1993 til 5. april 2007, har serveren blitt spurt en milliard ganger.

Initiativtakerne til utviklingen var Ron Appel (* 1959) og Amos Bairoch .

Se også

litteratur

  • ExPASy: SIB Bioinformatics Resource Portal - A Collaborative Effort. SIB Web Team (Konstantin Arnold, Panu Artimo, Delphine Baratin, Gabor Csardi, Edouard de Castro, Séverine Duvaud, Volker Flegel, Arnaud Fortier, Elisabeth Gasteiger, Aurélien Grosdidier, Céline Hernandez, Vassilios, Ioannidis, Manohar Jonnalageduzi, Sébastien Moretti, Khaled Mostaguir, Nicole Redaschi, Grégoire Rossier og Heinz Stockinger), Basel Computational Biology Conference, juni 2011

Individuelle bevis

  1. ↑ Jean-Michel Claverie; Cedric Notredame: Bioinformatikk for dummies . 2. utgave. Wiley Pub., Hoboken, NJ 2007, ISBN 0-470-08985-7 .
  2. ↑ Ekspasjonsfunksjoner

weblenker