Virgaviridae
| Virgaviridae | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
TEM- opptak av virioner av tobakkmosaikkvirus (TMV), | ||||||||||||||
| Systematikk | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Taksonomiske egenskaper | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Vitenskapelig navn | ||||||||||||||
| Virgaviridae | ||||||||||||||
| Venstre | ||||||||||||||
|
Den Virgaviridae er en familie av enkelt-trådet RNA- virus med positiv polaritet . Deres naturlige verter er planter. Det er for tiden minst 59 arter i denne familien, delt inn i 7 slekter. Navnet på familien er avledet av den latinske virgaen 'stick, stick' , også 'rod' (siden alle virus i denne familien er stavformet eller stavformet).
konstruksjon
Viruspartiklene ( virionene ) til Virgaviridae er ikke innhyllet, deres geometri er stivformet og har en spiralformet symmetri. Diameteren er 20-25 nm . Virionene har en sentral "kanal". RNARNARNA Genomet består av et lineært, enkeltstrenget positivt sense- RNA med en 3'- tRNA- lignende struktur og uten poly-A-hale . Avhengig av slekt kan genomet være i ett, to eller tre segmenter (mono-, bi- eller treparts). Konvoluttproteinene varierer i størrelse fra 19 til 24 kilodalton .
Formeringssyklus
Replikering av viruspartiklene er cytoplasmatisk (dvs. den finner sted i cytoplasmaet ) og følger replikasjonsmodellen av positive streng-RNA-virus. Transkripsjonsmetoden er også den vanlige for RNA-virus med positiv streng. Oversettelsen brukt ved lekk skanning [s] og undertrykkelse av avslutning.
De naturlige vertene er planter.
Systematikk
Internt system
Ifølge den internasjonale komiteen for taxonomi av virus (ICTV) i mars 2019, er den interne systematikken til Virgaviridae som følger:
Familie Virgaviridae
- Slekt: Furovirus
- Arter: Kinesisk hvetemosaikkvirus (CWMV)
- Arter: Japansk jordbåren hvetemosaikkvirus (JSBWMV)
- Arter: Havre gylden stripe-virus (OGSV)
- Arter: jord-bårne korn mosaikkvirus (SBCMV)
- Arter: jord-bårne hvete mosaikkvirus (SBWMV, type arter)
- Arter: Sorghum chlorotic spot virus
- Slekt: Goravirus
- Arter: Drakaea virus A (DVA)
- Arter: Gentian ovary ringspot virus (GORV, type arter)
- Slekt: Hordeivirus
- Arter: Anthoxanthum latent blanching virus
- Arter: Barley stripe mosaikkvirus (BSMV, type arter)
- Arter: Lychnis ringspot-virus
- Arter: Poa semilatent virus
- Slekt: Pecluvirus
- Arter: Indian Peanut Clump Virus (IPCV)
- Arter: Peanut clump virus (PCV, type arter)
- Slekt: Pomovirus
- Arter: Rødbete jordbåren virus
- Arter: Rødbetevirus Q (BVQ)
- Arter: Broad bean nekrosis virus
- Arter: Potet mopp-top virus (PMTV, type arter)
- Slekt: Tobamovirus
- Arter: Bell pepper mottle virus (BPeMV)
- Arter: Brugmansia mildt mottle virus
- Arter: Cactus mild mottle virus (CMMoV)
- Arter: Clitoria yellow mottle virus (CliYMV)
- Arter: Agurk frukt mottle mosaikkvirus (CFMMV0)
- Arter: Agurkgrønt mosaikkvirus ( Grünscheckungsmosaikvirus av agurk , CGMMV)
- Arter: Agurkmottlevirus (CMV)
- Arter: Frangipani mosaic virus (FrMV)
- Arter: Hibiscus latent Fort Pierce virus (HLFPV)
- Arter: Hibiscus latent Singapore virus (HLSV)
- Arter: Kyuri green mosaic mosaic virus ( Grünscheckungsmosaikvirus the Kyuri , KGMMV)
- Arter: Maracuja mosaic virus (MarMV)
- Arter: Obuda pepper virus (ObPV)
- Arter: Odontoglossum ringspot virus (ORSV)
- Arter: Paprika mildt mottle virus
- Arter: Pasjonsfruktmosaikkvirus
- Arter: Pepper mild mottle virus (PMMoV)
- Arter: Rattail kaktusnekrose-assosiert virus (RCNaV)
- Arter: Rehmannia mosaikkvirus
- Arter: Ribgrass mosaic virus (HRV)
- Arter: Sammons Opuntia-virus (SOV)
- Arter: Streptocarpus blomsterbruddvirus
- Arter: Sunn-hemp mosaic virus (SHMV)
- Arter: Tobakk latent virus (TLV)
- Arter: Tobakk mild grønn mosaikkvirus (TMGMV)
- Arter: Tobakksmosaikkvirus ( tobakkmosaikkvirus , TMV, T2MV)
- Arter: Tomato mosaikkvirus ( tomat mosaic virus , ToMV)
- Arter: Tomatmottle mosaic virus (ToMMV)
- Arter: Tropisk soda-eplemosaikkvirus
- Arter: Nepe -rensing-virus (TVCV)
- Arter: Ullucus mild mottle virus
- Arter: Wasabi mottle virus (WMoV)
- Arter: Gult haleblomst mildt mottle virus
- Arter: Youcai mosaikkvirus ( raps mosaic virus , YoMV, ORMV)
- Arter: Zucchini green mottle mosaic virus ( Grünscheckungsmosaikvirus zucchini , ZGMMV)
- Slekt: Tobravirus
- Arter: Pea early-browning virus (PEBV)
- Arter: Pepper ringspot virus (PEPRSV)
- Arter: Tobaksranglevirus ( Tobacco Rattle Virus , TRV)
Eksternt system
I 2015 Koonin et al taksonomisk tilordnet den Virgaviridae (på grunn av deres forhold) til det super 'Alfavirus-like-super' de postulert. Søstergruppen er deretter familien Closteroviridae . I følge forfatterne er slektstreet til denne supergruppen som følger:
| " Alphavirus- lignende superfamilie " |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
Medlemmene av denne foreslåtte supergruppen tilhører forskjellige grupper av Baltimore-klassifiseringen , vanligvis er de enkeltstrengede RNA-virus med positiv polaritet ((+) ssRNA, Baltimore gruppe 4), men det er også dobbeltstrengede representanter (merket med dsRNA, Finn Baltimore Group 3).
Selv om medlemmene er stavformede og infiserer planter, tilhører ikke slekten Benyvirus denne familien, men Benyviridae ; proteinene i de to gruppene er tilsynelatende bare i stor grad beslektet. I følge forslaget er en annen beslektet slekt Charavirus med arten Charavirus canadensis (CV-Can) og Charavirus australis (CV-Aus), disse virusene angriper karofytter .
weblenker
- Virgaviridae . ICTV Online Report
- Virgaviridae. Viral sone
Individuelle bevis
- ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2 . MSL # 34, mars 2019
- ↑ a b c d ICTV Master Species List 2019.v1. ICTV, ny MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2018b-utgivelsen, mars 2020 (MSL # 35)
- ↑ Michael J. Adams, Scott Adkins, Claude Bragard, David Gilmer, Dawei Li, Stuart A. MacFarlane, Sek-Man Wong, Ulrich Melcher, Claudio Ratti, Ki Hyun Ryu: ICTV Virus Taxonomy Profile: Virgaviridae . I: Journal of General Virology . 98, nr. 8, 1. august 2017, s. 1999–2000. doi : 10.1099 / jgv.0.000884 . PMID 28786782 . PMC 5656781 (fri fulltekst).
- ↑ a b c d e f g ICTV Report Virgaviridae .
- ↑ a b c d e f g Viral Zone . EXPASy. Hentet 2. september 2019.
- ↑ MJ Adams, JF Antoniw, J Kreuze: Virgaviridae : en ny familie av stavformede plantevirus . I: Arch Virol , 154 (12), 2009, s. 1967-1972
- Tax Virustaksonomi: 2015-utgivelse . ICTV. Hentet 4. juni 2016.
- ↑ virga | Latin → Tysk. Pons.de
- ↑ ICTV MSL # 34v 2018b.v2. ICTV , mars 2019
- ↑ MJ Adams, P. Jones, AG Swaby: Rensing og noen egenskaper av havre golden stripe virus , i: Annals of Applied Biology, April 1988, doi: 10.1111 / j.1744-7348.1988.tb02064.x
- ^ BE Min, BN Chung, MJ Kim, JH Ha, BY Lee, KH Ryu: Cactus mild mottle virus er et nytt kaktusinfiserende tobamovirus . I: Archives of Virology . 151, nr. 1, januar 2006, s. 13-21. doi : 10.1007 / s00705-005-0617-7 . PMID 16132178 .
- ↑ a b c Tobamovirien , på: Seminis
- ↑ Siden denne gruppen (referert til av forfatterne engelsk superfamilie ) inneholder en ordre med Tymovirales , må rangene deres være høyere enn dette og skal ikke forstås som en superfamilie . Rangene høyere enn ordren ble ikke gitt av ICTV på tidspunktet for arbeidet.
- ^ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Opprinnelse og utvikling av virus av eukaryoter: Den ultimate modulariteten . I: Virologi , mai 2015, s. 479-480. 2-25, Epub 12. mars 2015, PMC 5898234 (gratis fulltekst), PMID 25771806
- ↑ SIB: Alphatetraviridae , på: ViralZone
- ↑ SIB: Carmotetraviridae , på: ViralZone
- ↑ SIB: Permutotetraviridae , på: ViralZone
- ↑ SIB: Nodaviridae , på: ViralZone
- ↑ ICTV-rapport Benyviridae .
- ^ Marli Vlok, Adrian J. Gibbs. Curtis A. Suttle: Metagenomes of a Freshwater Charavirus from British Columbia Gi et vindu i gamle linjer av virus , i: Virus, bind 11, nr. 3, 299, 25. mars 2019, doi: 10.3390 / v11030299 , PMC 6466400 (friere Fulltekst), PMID 30934644