Endornaviridae

Endornaviridae
Endornaviridae virion.jpg

Endornaviridae- partikler. Den replikative formen (dsRNA) av (+) ssRNA-viruset er vist.

Systematikk
Klassifisering : Virus
Rike : Riboviria
Empire : Orthornavirae
Phylum : Kitrinoviricota
Klasse : Alsuviricetes
Bestilling : Martellivirales
Familie : Endornaviridae
Taksonomiske egenskaper
Genom : (+) ssRNA lineær
Baltimore : Gruppe 4

filamentøs

Deksel : ikke en skikkelig kapsid
Vitenskapelig navn
Endornaviridae
Venstre
NCBI  taksonomi: 564644
ViralZone ( ExPASy , SIB): 593
ICTV taxon historie: 201903042

Endornaviridae er navnet på en familie av virus . Planter, sopp og egg sopp fungerersom naturlige verter (Oomycetes: slektninger av brune og gyldne alger , ikke sopp). For tiden (fra april 2021) er det31 arter anerkjentav Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus (ICTV ) i denne familien, som er delt inn i to slekter ( Alphaendornavirus og Betaendornavirus ). Medlemmer av alphaendornavirus Infisere planter, sopp og egg soppen Phytophthora sp., Medlemmer av betaendornavirus infisere slange fungi ( Phylum /sekksporesopper avdeling ).

beskrivelse

TEM- bilde av dsRNA-molekyler i Oryza sativa endornavirus - isoler Nipponbare, alphaendornavirus
Genomkart (a) av Oryza sativa endornavirus- isolatet Nipponbare ( alphaendornavirus ) og (b) av Sclerotinia sclerotiorum endornavirus 1 ( betaendornavirus ). Tallene indikerer nukleotidposisjonene i genomet.

Genomet til Endornaviridae er et lineært enkeltstrenget RNA- molekyl med positiv polaritet med en lengde på ca. 14  kb (kilobaser) til 17,6 kb.

Siden genomet til Endornaviridae ikke har et gen for et kapsidprotein (CP), utvikler ikke medlemmene av denne familien ekte virioner. I Vicia faba endornavirus har imidlertid RNA-genomet vært assosiert med noen pleomorfe cytoplasmatiske membranvesikler .

Reproduksjonssyklus

Virusreplikasjon finner sted i cytoplasma. Den virale replikasjonsformen til Endornaviridae er et dobbeltstrenget RNA (dsRNA). Replikasjonen følger deretter modellen for replikering av dobbeltstrenget RNA ( dobbeltstrenget RNA-virusreplikasjonsmodell ). Den transkripsjon også følger modellen av transkripsjon av dsRNA-virus ( dobbelt-trådet RNA-virus transkripsjon ).

Siden den replikative formen av dsRNA er relativt stabil, kan den bli funnet i relativt høye nivåer i vertsvev og er derfor vanligvis et resultat av virusisolasjon . Av denne grunn, Endornaviridae blir ofte klassifisert som dsrna virus, selv om dette ikke er den offisielle ICTV klassifisering - (+) ssRNA -.

I dsRNA-form er det et brudd (en nick ) på et spesifikt punkt i den kodende strengen , omtrent 1 til 2  kbp (kilobase-par) fra 5'- terminalen .

Viruset forlater vertscellen ved å flytte fra celle til celle.

Planter, sopp og eggesopp fungerer som naturlige verter . Overføringen skjer via pollen .

Systematikk

Slektene som er anerkjent av ICTV (sammen med noen arter) er som følger:

Individuelle bevis

  1. ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2 . MSL # 34, mars 2019
  2. ↑ a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , Ny MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2018b-utgivelsen, mars 2020 (MSL # 35)
  3. ↑ a b c d e f g h i R. A. Valverde, M. E- Khalifa, R. Okada, T. Fukuhara, S. Sabanadzovic, Consortium ICTV Report: ICTV Virus Taxonomy Profile: Endornaviridae. . I: The Journal of General Virology . 100, nr. 8, august 2019, s. 1204-1205. doi : 10.1099 / jgv.0.001277 . PMID 31184570 .
  4. ↑ a b c d e f Viral Zone . EXPASy.
  5. Er Valerian V. Dolja: Capsid -mindre RNA-virus . I: eLS . 2001. doi : 10.1002 / 9780470015902.a0023269 . ISBN 978-0470016176 .
  6. ↑ ICTVdB Management (2006). 00.108.0.01. Endornavirus. I: ICTVdB - The Universal Virus Database, versjon 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA.
  7. ↑ NCBI: Oryza sativa endornavirus (isolere Japan) (ingen rang)

weblenker