Birnaviridae

Birnaviridae
ODR.Birna.Fig1.v1.c.png

Virion av IBDV , avibirnavirus

Systematikk
Klassifisering : Virus
Rike : Riboviria
Empire : Orthornavirae
Phylum : uklassifisert
Bestilling : uklassifisert
Familie : Birnaviridae
Taksonomiske egenskaper
Genom : dsRNA, 2 segmenter
Baltimore : Gruppe 3
Symmetri : icosahedral
Deksel : Nei
Vitenskapelig navn
Birnaviridae
Venstre

Familien Birnaviridae består av tre slekter av virusarter med dobbeltstrenget RNA , som ligner familien Partitiviridae i to segmenter. Familienavnet er avledet fra egenskapen til denne segmenteringen (bi-RNA). Virusene i denne familien har ingen likheter i nukleinsyresekvensen med andre virus taxa. VP4 protease av de Birnaviridae viser homologiene til en ATP -avhengig protease i bakterier og organeller . I følge nylige studier er det likheter i den sekundære strukturen til den virale RNA-avhengige RNA-polymerase (RdRP) av Birnaviridae med medlemmer av den tidligere familien Tetraviridae (2011 av International Committee on Taxonomy of Virus (ICTV) delt inn i familiene Alphatetraviridae , Carmotetraviridae og Permutotetraviridae . Disse funnene tillater konklusjonen at Birnaviridae tilhører de eldste virusene i evolusjonære termer .

Systematikk

Internt system

Følgende fordeling på slekter av Birnaviridae følger kravene fra Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus (ICTV) fra og med november 2018,

Eksternt system

I 2015 Koonin et al taksonomisk tilordnet den Birnaviridae (på grunn av deres forhold) til det super 'Alfavirus-like-super' de postulert. I nære slektninger er det familiene som tidligere var gruppert som ' Tetraviridae ': Alphatetraviridae , Carmotetraviridae og Permutotetraviridae (ennå ikke differensiert av forfatterne). Medlemmene av denne foreslåtte supergruppen tilhører forskjellige grupper av Baltimore-klassifiseringen , vanligvis enkeltstrengede RNA-virus med positiv polaritet ((+) ssRNA, Baltimore gruppe 4); men det er også - som Birnaviridae  - dobbeltstrengede representanter (merket med dsRNA, Baltimore gruppe 3) å finne.

Dette forslaget er nå erstattet av ICTV Master Species List # 35 fra mars 2020. En sammenligning av kladogrammer finnes i Tymovirales § ICTV Master Species List # 35 .

litteratur

  • P. Dobos, BJ Hill, R. Hallett, DT Kells, H. Becht, D. Teninges: Biofysisk og biokjemisk karakterisering av fem dyrevirus med bisegmenterte dobbeltstrengede RNA-genomer . I: J Virology , 1979, 32 (2), s. 593-605, PMID 228080 (med EM-bilder)
  • B. Delmas, FSB Kibenge et al.: Familie Birnaviridae . I: CM Fauquet, MA Mayo et al.: Åttende rapport fra den internasjonale komiteen for taxonomi av virus . London San Diego 2004, s. 561 ff.

Individuelle bevis

  1. ICTV Master Species List 2018b.v2 . MSL # 34, mars 2019
  2. a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , Ny MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2018b-utgivelsen, mars 2020 (MSL # 35)
  3. a b Master Species List 2018a v1 ICTV , MSL (# 33) inkludert alle taxaoppdateringer siden 2017-utgivelsen. Høst 2018
  4. AE Gorbalenya, FM Pringle, JL Zeddam, BT Luke, CE Cameron, J Kalmakoff, TN Hanzlik, KH Gordon, VK Ward: Det palmedomdomenebaserte aktive stedet er internt permuert i virale RNA-avhengige RNA-polymeraser av en eldgammel slekt . I: J Mol Biol. , 2002, 15; 324 (1), s. 47-62, PMID 12421558
  5. ^ Michel Comps, Bruno Menu: Smittsomme sykdommer som påvirker masseproduksjon av marinroteren Brachionus plicatilis , i: Hydrobiologia, desember 1997, bind 358, utgave 1-3, s. 179-183
  6. Siden denne gruppen (referert til av forfatterne engelsk superfamilie ) inneholder en ordre med Tymovirales , må rangene deres være høyere enn dette og skal ikke forstås som en superfamilie . Rangene høyere enn ordren ble ikke gitt av ICTV på tidspunktet for arbeidet.
  7. ^ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Opprinnelse og utvikling av virus av eukaryoter: Den ultimate modulariteten . I: Virologi , mai 2015, s. 479-480. 2-25, Epub 12. mars 2015, PMC 5898234 (fulltekst), PMID 25771806