Dicistroviridae

Den Dicistroviridae er en familie av RNA-virus som infiserer flere arter av insekter . Den Dicistroviridae infisere blant annet rør-bladlus ( Aphididae ), fluer , dverg leafhoppers , bier , maur og silke møll .

konstruksjon

Virion

Skjema tegninger av viruspartikler av familien Dicistroviridae

Molekylære overflater av Triatomavirus (TrV) og Cricket Paralysis Virus (CrPV). VP n = CP n .

Discistroviruses har en ikke-innhyllede tyveflatede kapsid omtrent 30 nm i diameter med triangulering antall pseudo-3. Kapsiden består av fire kapsidproteiner CP1-4 , hvorav CP1-3 er på overflaten av kapsiden og CP4 på innsiden av kapsiden.

Genom

Cricket Paralysis Virus (CrPV) genom

Dicistroviruses har et genom som består av et enkeltstrenget RNA-molekyl med positiv polaritet , som bærer virusproteinet VPg i 5'- enden og en poly-A-hale i 3'-enden . Navnet Dicistroviridae kommer fra genomets di cistroniske struktur, de har to ikke-overlappende åpne leserammer . Noen dicistrovirus ble opprinnelig regnet blant picornavirusene . Dicistrovirusene hører sammen med andre familier som Picornaviridae , Iflaviridae og Secoviridae (sistnevnte inkluderer tidligere familier Sequiviridae og Comoviridae ) til virusordenen Picornavirales , Picornavirales i sin tur, sammen med andre familier som Potyviridae og Totiviridae, tilhører den foreslåtte gruppen super picornavyirus united. Denne superfamilien (faktisk superordner) har sekvensen til genene i genomet Hel (Helicase) -Pro (protease) -RdRp (RNA-polymerase) og i den andre åpne leserammen CP1-CP4-CP2-CP3. I motsetning til de fleste andre medlemmer av superfamilien, er kapsidproteinene lokalisert ved 3'-enden av genomet, og bare dicistrovirus og comovirus har to åpne leserammer.

Cripavirusene har hver sin IRES i 5'- enden av begge åpne leserammer, som brukes som et alternativt startpunkt for oversettelse. I Cricket paralysis virus blir proteinet VP1A opprettet fra den første åpne leserammen via et hopp i leserammen .

Proteiner

Fra hver åpne leseramme genereres et polyprotein fra genomet , som deretter brytes ned i sine endelige komponenter ved proteolyse .

Systematikk

Internt system

Ifølge ICTV består familien Dicistroviridae fra og med november 2018 av tre slekter:

• Slekt: Aparavirus
  • Arter: Akutt Bienenparalysevirus ( engelsk Acute bee paralysis virus , ABPV, type arter)
  • Arter: Israelsk akutt lammelsesvirus ( israelsk akutt Bienenparalyse-virus , en. Israelsk akutt lammelsesvirus , IAPV)
  • Arter: Kashmir bee virus ( engelsk Kashmir bee virus , KBV)
  • Arter: Mud krabbe virus (MCDV, Mud krabbe dicistrovirus-1 , infiserer svømming krabber av slekten Scylla )
  • Arter: Solenopsis invicta virus 1 (SINV-1) - et brannmyrevirus , art Solenopsis invicta
  • Arter: Taura Syndrome Virus ( engelsk Taura syndrom virus , TSV)
• Slekt Cripavirus (tidligere Cricket lammelseslignende virus ):
  • Arter: Cricket paralysis virus ( engelsk Cricket paralysis virus , CrPV, type arter)
  • Arter: Aphid letal paralysis virus (ALPV, også Aphid deadal virus )
  • Arter: Drosophila C-virus (DCV)
  • Arter: Rhopalosiphum padi virus (RhPV)
• Slekt triatovirus :
  • Arter: Triatomevirus ( engelsk triatomevirus , TrV, type art, angriper rovdyr av slekten Triatoma i underfamilien Triatominae )
  • Arter: Svart Queens celle virus ( engelsk svart dronning celle virus , BQCV) - en honningbie virus
  • Arter: Himetobi P-virus (HiPV)
  • Arter: Homalodisca coagulata virus 1 (HoCV-1)
  • Arter: Plautia stali tarmvirus (PSIV)

• " Big Sioux River virus " (BSRV)

• Andre foreslåtte arter (utvalg):
  • " Cloudy wing virus " ( engelsk Cloudy wing virus , CWV)
  • " Blackberry virus Z "
  • Acheta domesticus-virus
  • " Ervivirus "
  • " Bombyx mori smittsomme flattvirus" (BmIFV)

Ytterligere forslag finner du i Wamonje et al. (2017).

Eksternt system

Med Master arts List (MSL) nr. 35 i mars 2020 tildelte ICTV Dicistroviridae til ordren Picornavirales . Et kladogram finner du der under Picornavirales §ICTV Master Species List # 35 .

litteratur

• YP Chen et al.: Family Dicistroviridae . I: AMQ King, MJ Adams, EB Carstens, EJ Lefkowitz (red.): Virus Taxonomy. Niende rapport fra den internasjonale komiteen for taxonomi av virus. Amsterdam 2012. s. 840-842 ISBN 978-0-12-384684-6 .
• DM Knipe, Peter M. Howley , DE Griffin, (red.): Fields Virology. 5. utgave, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7 .

weblenker

• MeSH Dicistroviridae
• Dicistroviridae. ViralZone, Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
• Indeks over virus - Dicistroviridae . I: C. Büchen-Osmond (red.): ICTVdB - The Universal Virus Database, versjon 4 . Columbia University, New York 2009. ncbi.nlm.nih.gov .

Individuelle bevis

1. ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2 . MSL # 34, mars 2019
2. ↑ ^{a b c d} ICTV: ICTV taksonomihistorie: Enterovirus C , EC 51, Berlin, Tyskland, juli 2019; Ratifisering av e-post mars 2020 (MSL # 35)
3. ↑ LE Hunnicutt, WB Hunter, RD Cave, CA Powell, JJ Mozoruk: Genomsekvens og molekylær karakterisering av Homalodisca coagulata virus-1 , et nytt virus oppdaget i den glassete vingede skarpskytteren (Hemiptera: Cicadellidae). I: Virology , 2006, 350, s. 67-78.
4. ↑ JR de Miranda, G. Cordoni, G. Budge: Acute bie lammelse virus-Kashmir bie virus-israelsk akutt lammelse viruskomplekset . I: Journal of Invertebrate Pathology , 2010, 103, s. S30-S47
5. ↑ SM Valles, CA Strong, PM Dang, WB Hunter, RM Pereira, DH Oi, AM Shapiro, DF Williams: En Picorna-lignende virus fra den røde importert brann maur, Solenopsis Invicta : innledende oppdagelse, genomsekvens, og karakterisering . I: Virology , 2004, 328, s. 151-157.
6. ↑ WB Hunter, CS Katsar, JX Chaparro: Molekylær analyse av kapsidprotein av Homalodisca coagulata-virus-1 , et nytt bladhopperinfiserende virus fra den glassaktige skarpskytteren, Homalodisca coagulata. I: Journal of Insect Science , 2006, 6, s.31
7. ↑ ICTV : Rapporter: Picornavirales> Secoviridae , april 2017
8. ↑ Se Picornavirales § Ekstern systematikk
9. ^ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Opprinnelse og evolusjon av virus av eukaryoter: Den ultimate modulariteten . I: Virologi , mai 2015, s. 479-480. 2-25, Epub 12. mars 2015, PMC 5898234 (fulltekst), PMID 25771806
10. ↑ Y Kanamori, Nakashima N: En tertiær strukturmodell av det interne ribosominngangssiden (IRES) for metioninuavhengig initiering av translasjon . I: RNA . 7, nr. 2, 2001, s. 266-274. doi : 10.1017 / S1355838201001741 . PMID 11233983 . PMC 1370084 (fri fulltekst).
11. ↑ Malys N, McCarthy JEG: Oversettelse initiering: variasjoner i mekanismen kan forventes . I: Cellular and Molecular Life Sciences . 68, nr. 6, 2010, s. 991-1003. doi : 10.1007 / s00018-010-0588-z . PMID 21076851 .
12. ↑ MI Hertz, SR Thompson: Mekanisme oversettelse initiering av Dicistroviridae IGR IRESs. I: Virologi. Volum 411, nummer 2, mars 2011, s. 355-361, ISSN  1096-0341 . doi: 10.1016 / j.virol.2011.01.005 . PMID 21284991 . PMC 3076094 (fri fulltekst).
13. ↑ ICTV : Master Species List 2018a v1 MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2017-utgivelsen. Høst 2018 (MSL # 33)
14. ↑ ^{a b c} Laura M. Brutscher, Katie F. Daughenbaugh, Michelle L. Flenniken: Antivirale forsvarsmekanismer i honningbier , i: Curr Opin Insect Sci. Nr. 10, august 2015, s. 71–82, doi: 10.1016 / j.cois.2015.04.016 , PMC 4530548 (fri fulltekst), PMID 26273564
15. ↑ Benjamin Dainat, Anton Imdorf, Jean-Daniel Charrière, Peter Neumann: bee virus (del 2). (PDF) In: Schweizerische Bienen-Zeitung , 5/2008, Center for Bee Research, Agroscope Liebefeld-Posieux ALP, 3003 Bern
16. ↑ ^{a b} Annegret Wagner: Døde bier: forgiftning eller virusinfeksjon? I: Tierarzt , 15. desember 2019
17. ↑ Bi lammelsesvirus . I: Die Honigmacher , German Beekeeping Association e. V., nybegynnerkurs. Per 5. oktober 2015
18. ↑ Elke Genersch: Bee virus , en kort oversikt . (PDF) State Institute for Apiculture Hohen Neuendorf e. V.; åpnet 28. januar 2021
19. ↑ NCBI: Kashmir bivirus (art)
20. ↑ Y. Gao et al.: Cryo-EM-strukturer av nye virus fra gjørmekrabbe Scylla Paramamosain med flere infeksjoner . I: J Virol. 16. januar 2019, pii: JVI.02255-18. doi: 10.1128 / JVI.02255-18 , PMID 30651355
21. ^ Cricket lammelsesvirus. ICTV 8. rapport, Virusworld
22. ↑ Picornavirus . I: Lexicon of Biology på Spektrum.de
23. ↑ S. Liu, D. Vijayendran, J. Carrillo-Tripp, W. A. Miller, B.C. Bonning: Analyse av ny bladlus dødelig lammelse virus (ALPV) isolerer antyder utviklingen av to ALPV arter . I: J Gen Virol. , 95 (Pt 12), desember 2014, s. 2809-2819, doi: 10.1099 / vir.0.069765-0 , PMID 25170050
24. ↑ Norman Carreck, Brenda V Ball, Stephen J Martin: Epidemiologien av overskyet vingevirusinfeksjoner i honningbikolonier i Storbritannia . I: Journal of Apicultural Research , 49 (1), s. 66-71, januar 2010, researchgate.net doi: 10.3896 / IBRA.1.49.1.09
25. ↑ Hélène Berthoud, Anton Imdorf, Jean-Daniel Charrière, Monika Haueter, Peter Fluri: Bivirus - et lite kjent område . (PDF) Center for Bee Research, Agroscope Liebefeld-Posieux, Liebefeld / Bern 2005
26. ↑ NCBI: Acheta domesticus-virus (art)
27. ↑ Francis O. Wamonje et al.: Viral metagenomics av ​​bladlus som er tilstede i bønne- og maistomter på blandede bruk i Kenya Avdekker tilstedeværelsen av tre dicistrovirus Inkludert en roman Big Sioux River viruslignende dicistrovirus . I: Virol J , 2. oktober 2017, bind 14, nr. 1, s. 188, doi: 10.1186 / s12985-017-0854-x , PMID 28969654 , PMC 5625602 (fri fulltekst)
28. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , Ny MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2018b-utgivelsen, mars 2020 (MSL # 35)