Totiviridae
| Totiviridae | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Systematikk | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Taksonomiske egenskaper | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Vitenskapelig navn | ||||||||||||||
| Totiviridae | ||||||||||||||
| Venstre | ||||||||||||||
|
Totiviridae er en familie av RNA-virus med dobbeltstrenget RNA - genom .
kjennetegn
De viruspartikler (virioner) av Totiviridae har en tyveflatede kapsid uten virus konvolutt fra omkring 36 til 40 nm diameter med en triangulering antall av en på den indre kapsid lag og tretten på den ytre.
Genomene til totivirusene kan deles inn i to typer: med overlappende gener eller uten overlapping. Genomet består av et lineært dobbeltstrenget RNA på 4,6 til 6,7 kbp (kilobasepar) med to åpne leserammer ( gag og pol ), som produseres under kontroll av en RNA-pseudoknot. I den første typen produseres proteinene som et fusjonsprotein fra begge gener som overlapper med ca. 210 basepar via en + 1 eller - 1 leserammeskift, mens i den andre typen gener ikke overlapper og oversettes individuelt . Den Gag -protein er capsidproteinet og Pol -proteinet er en RNA-polymerase på omkring 190 kilodalton. Kapsidet består av Gag -protein på omtrent 100 kilodalton , som innledningsvis dannes asymmetriske dimerer etter acetylering av den N-terminale ende . De aggregerte kapsidproteinene binder den RNA-avhengige RNA-polymerase Pol , som igjen binder RNA, som et resultat av at en nydannet virion blir samlet. Noen totivirus har en tredje åpen leseramme. Totivirus oppsto antagelig uavhengig av andre RNA-virus med et dobbeltstrenget genom fra RNA-virus med et enkeltstrenget genom med positiv polaritet (se nedenfor).
Systematikk
Internt system
Følgende fordeling i fem slekter og 28 arter av Totiviridae følger kravene fra Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus (ICTV) fra mars 2020:
- Familie Totiviridae
-
- Slekt Giardia-virus
- Arter Giardia lamblia virus (type)
- Slekt leishmania virus
- Arter Leishmania RNA-virus 1 (type)
- Arter Leishmania RNA-virus 2
-
- Slekt totivirus
- Arter Saccharomyces cerevisiae virus LA (type)
- Arter Saccharomyces cerevisiae virus LBCLa
- Arter Scheffersomyces segobiensis virus L
- Art Tuber aestivum virus 1
- Arter Ustilago maydis-virus H1
- Arter Xanthophyllomyces dendrorhous virus L1A
- Arter Xanthophyllomyces dendrorhous virus L1B
- Slekt Trichomonas-virus
- Arter Trichomonas vaginalis virus 1 (type)
- Arter Trichomonas vaginalis virus 2
- Arter Trichomonas vaginalis virus 3
- Arter Trichomonas vaginalis virus 4
-
- Slekten Victorivirus
- Arter Aspergillus foetidus slow virus 1
- Arter Beauveria bassiana victorivirus 1
- Arter Chalara elegans RNA Virus 1
- Arter Coniothyrium minitans RNA-virus
- Arter Epichloe festucae virus 1
- Arter Gremmeniella abietina RNA-virus L1
- Arter Helicobasidium mompa totivirus 1-17
- Arter Helminthosporium victoriae virus 190S (HvV190S, type)
- Arter Magnaporthe oryzae-virus 1
- Arter Magnaporthe oryzae-virus 2
- Arter Rosellinia necatrix victorivirus 1
- Arter Sphaeropsis sapinea RNA-virus 1
- Arter Sphaeropsis sapinea RNA-virus 2
- Arter Tolypocladium cylindrosporum virus 1
Eksternt system
I 2015 tildelte Koonin et al Totiviridae taksonomisk (på grunn av deres forhold) til en av deres postulerte supergrupper, "Picornavirus-lignende superfamilie". Medlemmene av denne foreslåtte supergruppen tilhører forskjellige grupper av Baltimore-klassifiseringen , vanligvis enkeltstrengede RNA-virus med positiv polaritet ((+) ssRNA, Baltimore-gruppe 4), men de er også - som Birnaviridae - dobbeltstrengede representanter (merket med dsRNA, Baltimore Group 3). Dette forslaget er nå erstattet av ICTV Master Species List # 35 fra mars 2020. En sammenligning av kladogrammer finnes i Picornavirales § ICTV Master Species List # 35 .
weblenker
- MeSH Totiviridae
- Viral sone : Totiviridae
- ICTV: Virusindeks - Totiviridae . I: ICTVdB - The Universal Virus Database, versjon 4 . Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York 2009. [1] .
Individuelle bevis
- ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL # 34, feb.2019
- ↑ a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , Ny MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2018b-utgivelsen, mars 2020 (MSL # 35)
- ↑ a b c d D. M. Knipe, Peter M. Howley , D. E. Griffin, (Red.): Fields Virology. 5. utgave, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7 .
- B a b c d e M. A. Hartley, C. Ronet, H. Zangger, S. M. Beverley, N. Fasel: Leishmania RNA-virus: når verten betaler bompenger. I: Grenser i mobil- og infeksjonsmikrobiologi. Volum 2, 2012, s. 99, ISSN 2235-2988 . doi: 10.3389 / fcimb.2012.00099 . PMID 22919688 . PMC 3417650 (fri fulltekst).
- ^ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Opprinnelse og evolusjon av virus av eukaryoter: Den ultimate modulariteten , i: Virologi fra mai 2015; 479-480. 2-25, Epub 12. mars 2015, PMC 5898234 (fulltekst), PMID 25771806