Rna-virus
Som RNA-virus (flertall RNA-virus , synonym RNA-virus , Ribovirus ) refererer til virus hvis genetiske materiale ( genom ) av RNA (forkortelse for engelsk ribonukleinsyre , "ribonukleinsyre") er. Begrepet RNA-virus er ikke en samlebetegnelse for taksonomi og inneholder ingen familiehenvisninger.
En nøyaktig klassifisering av RNA-virus er i Baltimore-gruppene 3 (dobbeltstrenget RNA-genom), 4 (enkeltstrenget RNA-genom med positiv polaritet) og 5 (enkeltstrenget RNA-genom med negativ polaritet) og (fremdeles ufullstendig) taksonomi av virus laget.
Riboviria
Riboviria | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Skaler tverrsnitt av | ||||||
Systematikk | ||||||
| ||||||
Taksonomiske egenskaper | ||||||
| ||||||
Vitenskapelig navn | ||||||
Riboviria | ||||||
Venstre | ||||||
|
Riboviria er fra International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) 2018/2019 nyopprettet taxon av høyeste rang Realm ( engelsk rike ), analogt med domenet i cellulære organismer (levende ting). Denne rangen erstatter i økende grad den gamle Baltimore-klassifiseringen .
Riboviria inkluderer i utgangspunktet alle virkelige RNA-virus (Baltimore-gruppene 3 , 4 og 5 ). På grunn av store strukturelle forskjeller ble imidlertid Baltimore Group 5- satellittvirus (som slekten Deltavirus med hepatitt D-virus ) fjernet i 2019/2020. Imidlertid er omvendt transkriberende virus nye :
Når det gjelder retrovirus (Baltimore-gruppe 6 ), blir RNA transkribert til DNA under replikasjon i vertscellen infisert av viruset ved hjelp av et enzym , revers transkriptase . Disse inkluderer ikke bare familien Retroviridae (retrovirus i snever forstand) noen andre mindre familier som Belpauviridae , Metaviridae og Pseudoviridae .
Virus som replikerer DNA-genomet sitt via et mellomliggende RNA-trinn blir noen ganger referert til som pararetrovirus. Du trenger også en omvendt transkriptase for dette (Baltimore gruppe 7 ). Dette inkluderer familien Caulimoviridae , som på grunn av homologier er plassert i den vanlige ordenen Ortervirales med ovennevnte retrovirusfamilier .
eiendommer
RNA virus omfatter de fleste plantevirus, mange dyrevirus, og noen bakteriofager . RNA-virusene kan være innhyllet eller ikke, RNA enkeltstrenget (ssRNA) eller dobbeltstrenget (dsRNA), positivt eller negativt strengorientert , med et segmentert eller usegmentert genom .
Patogenene til det store flertallet av de nylig oppkomne virussmittsomme sykdommene de siste tiårene (variasjoner av influensavirus , SARS , SARS-CoV-2 ) og Ebola- virus , men også de årtusen gamle rabiespatogenene er RNA-virus.
variasjon
RNA-virus skyldes den høyere feilraten for RNA-polymeraser som er mye mer variabel enn DNA-virus, fordi deres RNA-polymerase vanligvis ikke er korrekturlesing - exonuklease har funksjon. Et unntak er nidovirales , som har en korrekturlesingsfunksjon med exoribonuklease ExoN , noe som betyr at genomstørrelsen er noe mindre begrenset. På grunn av den høye mutasjonshastigheten produserer RNA-virus mer defekte, ikke-smittsomme viruspartikler, som omtales som kondisjonskostnader på grunn av redusert funksjonalitet . Men de kan også tilpasse seg raskt til nye verter eller mellomverter i løpet av en immununndragelser og unnslippe den immunrespons gjennom flukt mutasjon . Likevel er det konserverte områder av virusgenomet der et høyt utvalgstrykk virker på funksjonen til den konserverte sekvensen. I hepatitt C-viruset er det for eksempel et konservert område nær kjerneproteinet , hvor RNA inneholder en IRES . På grunn av den lavere genetiske bevaringen sammenlignet med DNA-virus og den høye genetiske variabiliteten , må vaksiner tilpasses oftere til nåværende sirkulerende virusstammer. Dette gjør det også vanskeligere å bestemme tidspunktet for utviklingen av RNA-virusene i betydningen molekylær klokke .
Vert motstand
I løpet av samevolusjonen av RNA-virus og deres verter har forskjellige mekanismer for forsvar mot RNA-virus utviklet seg i vertene. Blant de motstandsfaktorene menneske mot RNA-viruser inkluderer RNA-interferens , noe PAMP reseptorer, er proteinkinase R . I tillegg finner immunresponsen sted. Imidlertid har RNA-virus også utviklet flere mekanismer for å omgå motstand.
Systematikk
RNA-virusene er klassifisert i Baltimore-gruppe 3, 4 og 5 (men som ikke er taksonomiske grupper, dvs. kin-grupper).
Gruppe III: dsRNA-virus
Det er tolv familier og noen ikke tildelte slekter:
-
Amalgaviridae familie
- Slekt amalgavirus
- Slekt Zybavirus
- Familie Birnaviridae
- Familie Chrysoviridae
- Slekten Alphachrysovirus
- Slekt Betachrysovirus med arter Colletotrichum fructicola chrysovirus 1
- Familie Cystoviridae
- Familie Endornaviridae
- Familie Megabirnaviridae
- Slekten Megabirnavirus
- Familie Partitiviridae
- Slekt alphapartitivirus
- Beta-partitivirus fra slekten
- Slekt gammapartitivirus
- Slekt deltapartitivirus
- genus cryspovirus
- Familie Picobirnaviridae
- Slekten Picobirnavirus
- Familie Quadriviridae
- Slekt quadrivirus
- Reoviridae- familien
- Familie Quadriviridae
- Slekt quadrivirus
- Familie Totiviridae
- Familien ikke bestemt
- Slekt Botybirnavirus , med arter Botrytis porri botybirnavirus 1
- Kjønn ikke bestemt
Gruppe IV: positive strandede ssRNA-virus
Gruppe IV består av tre ordrer, over 34 familier og noen ikke tildelte virustyper og slekter.
- Bestill nidovirales
- Underordning Abnidovirineae
-
Familie Abyssoviridae
- Underfamilien Tiamatvirinae
- Slekt Alphaabyssovirus - Undergenus : Aplyccavirus
- Underfamilien Tiamatvirinae
- Familie Arteriviridae
-
Familie Abyssoviridae
- Underordning av Cornidovirineae
- Coronaviridae familie
- Underordning Mesnidovirineae
- Familie medioniviridae
- Underfamilie Medionivirinae
- Slekt Turrinivirus - Subgenus: Beturrivirus
- Underfamilien Tunicanivirinae
- Slekt Bolenivirus - Undergenus : Balbicanovirus
- Underfamilie Medionivirinae
- Familie Mesoniviridae
- Underfamilie Hexponivirinae
- Slekt Alphamesonivirus - Undergenera: Casualivirus , Enselivirus , Hanalivirus , Kadilivirus , Karsalivirus , Menolivirus , Namcalivirus , Ofalivirus
- Underfamilie Hexponivirinae
- Familie medioniviridae
- Underordning Monidovirineae
- Familie Mononiviridae
- Underfamilie Mononivirinae
- Slekt Alphamononivirus - Undergenus : Dumedivirus
- Underfamilie Mononivirinae
- Familie Mononiviridae
- Underordning Ronidovirineae
- Familie Euroniviridae
- Underfamilie Ceronivirinae
- Slekt Charybnivirus - Subgenera: Cradenivirus , Wenilivirus
- Underfamilie Crustonivirinae
- Slekt Paguronivirus - Undergenus : Behecravirus
- Underfamilie Ceronivirinae
- Familie Roniviridae
- Underfamilien Okanivirinae
- Slekt Okavirus - Undergenus : Tipravirus
- Underfamilien Okanivirinae
- Familie Euroniviridae
- Underordnet Tornidovirineae
- Familie Tobaniviridae
- Underfamilie Piscanivirinae
- Underfamilien Remotovirinae
- Slekt Bostovirus - Subgenus: Bosnitovirus
- Underfamilien Serpentovirinae
- Slekt Infratovirus - Undergenus : Xintolivirus
- Slekt Pregotovirus - Subgenus: Roypretovirus
- Slekt Sectovirus - Undergenus : Sanematovirus
- Slekten Tiruvirus - Undergenus : Tilitovirus
- Underfamilie Torovirinae (tidligere Fam. Coronaviridae )
- Familie Tobaniviridae
- Underordning Abnidovirineae
- Bestill picornavirales
- Familie Dicistroviridae
- Familie Iflaviridae
- Familie Marnaviridae
- Familie Picornaviridae
- Polycipiviridae familie
- Slekt Chipolycivirus
- Slekt Hupolycivirus
- Slekt sopolycivirus
- Familie Secoviridae
- Underfamilie Comovirinae
- Slekt comovirus
- Slekt Fabavirus
- Slekt Nepovirus , med arten Sikori-gult flettetvirus , Grapevine bulgarsk latent virus , Grapevine fanleaf-virus , Myrobalan latent ringspot-virus , tomat svart ringvirus - no. Tomat svart ring virus ; Arabis Mosaic Virus - no. Arabis mosaikkvirus , samt Beet ringspot-virus
- Underfamilie ikke bestemt
- Slekt Cheravirus
- Slekt Sadwavirus
- Slekt Sequivirus
- Slekt Torradovirus
- Slekt Waikavirus
- Underfamilie Comovirinae
- Bestill tolivirales
- Familie Carmotetraviridae
- Slekt Alphacarmotetravirus , med Species Providence virus
- Familie Luteoviridae
- Familie Tombusviridae
- Familie Carmotetraviridae
- Bestill tymovirales
- Familie Alphaflexiviridae
- Slekt allexivirus
- Slekt botrex-virus
- Slekt Lolavirus
- Slekt Mandarivirus
- Slekt Platypuvirus
- Slekt Potex-virus
- Slekt Sclerodarnavirus
- Familie Betaflexiviridae
- Underfamilie Quinvirinae
- Slekt Carlavirus
- Slekt fovea virus
- Slekten Robigovirus
- Underfamilie Trivirinae
- Slekt Capillovirus
- Slekt chordovirus
- Slekt Citrivirus
- Genus Diva-virus
- Genus beskjære virus
- Slekt tepovirus
- Slekt Trichovirus
- Slekt Vitivirus
- Underfamilie Quinvirinae
- Familie Gammaflexiviridae
- Slekt Mycoflexivirus
- Familie Deltaflexiviridae
- Slekten Delta Flexivirus
- Familie Tymoviridae
- Slekt Maculavirus
- Slekt marafivirus
- Genus Tymovirus , med arter Wild agurk mosaikk virus og gul bete mosaikk virus . Ripegult mosaikkvirus (TYMV)
- Familie Alphaflexiviridae
- Bestilling ikke bestemt:
- Familie Alphatetraviridae
- Slekt beta tetravirus
- Slekt omegatetravirus
- Familie Alvernaviridae
- Slekt dinornavirus
- Familie Alvernaviridae
- Slekt amalgavirus
- Slekt Zybavirus
- Astroviridae familie
- Slekt Avastrovirus
- Slekt Mamastrovirus
- Slekt ' bastro virus '
- Familie Barnaviridae
- Slekt barnavirus
- Benyviridae familie
- Slekt Benyvirus , med arter Beet nekrotisk gul venevirus (satellittlignende RNA)
- Familie Botourmiaviridae (aka Ourmiaviridae )
- Slekt botoulivirus
- Slekt Magoulivirus
- Slekt Ourmiavirus
- Slekt scleroulivirus
- Familie Bromoviridae
- Familie Caliciviridae
- Familie Carmotetraviridae
- Slekten Alphacarmotetravirus
- Familie Closteroviridae
- Familie Flaviviridae
- Familie " Fusariviridae "
- Familie Hepeviridae
- Familie Hypoviridae
- Slekt hypovirus
- Kitaviridae familie
- Slekt Blunervirus , med arter Blueberry necrotic ring blotch virus (BNRBV)
- Slekt Cilevirus (CiLV)
- Slekt Higrevirus , med arten Hibiscus green spot virus 2 (HGSV-2)
- Familie Leviviridae
- Familie Luteoviridae
- Slekt enamovirus
- Slekt Luteovirus , med Barley Yellow Dwarf-virusene . Barley gul dverg-virus MAV (BYDV-mav), bygg gul dverg-virus PAV (BYDV-PAV) og bygg gul dverg-virus PAS (BYDV-PAS)
- Genus Polerovirus , med artene Cereal gul dvergvirus RPV (CYDV-RPV) og Cereal gul dverg-virus RPS (CYDV-RPS)
- Familie Matonaviridae
- Slekten Rubivirus (tidligere Togaviridae ), med det eneste arten rubellavirus . Rubella virus (RUBV)
- Familie Narnaviridae
- Slekt Mitovirus
- Slekten Narnavirus
- Familie Nodaviridae
- Familie Permutotetraviridae
- Slekten Alphapermutotetravirus
- Familie Potyviridae
- Familie Sarthroviridae (foreslått å være satellittvirus )
- Slekten Macronovirus , med den eneste arten Macrobrachium satellittvirus 1 , til dette Extra small virus (XSV)
- Familie Solemoviridae
- Slekt polemovirus
- Slekt Sobemovirus , med arten Cymbidium ringspot-virus
- Familie Solinviviridae
- Slekten Invictavirus , med arten Solenopsis invicta virus 3
- Slekten Nyfulvavirus , med arten Solenopsis invicta virus 3
- Familie Togaviridae
- Familie Tombusviridae
- Familie Virgaviridae
- Familien ikke bestemt:
- Slekt Jingmenvirus med arter Jingmen tick virus (JMTV ,? Fam. Flaviviridae )
- Slekt Ideaovirus , med Species Privet idaeovirus
- Slekt Sinaivirus med arter Lake Sinai Virus 1 og 2
- Slekten ' Negevirus ', med arten ' Blackford virus ', ' Bofa virus ', ' Buckhurst virus ', ' Marsac virus ', 'samt Muthill virus '
- Familie Alphatetraviridae
- Ikke tildelt gruppe:
- ' Orsay-virus '
- ' Le Blanc-virus '
- ' Santeuil-virus '
- Kjønn ikke bestemt og ikke i ICTV Master Species List (Issue # 34)
- ' Acyrthosiphon pisum virus ' (APV)
- ' Chara australis virus ' (CAV), alias ' Chara corallina virus '
- ' Nesidiocoris tenuis virus 1 ' (NtV-1)
- ' Plasmopara halstedii virus ' (PhV)
- ' Rosellinia necatrix fusarivirus 1 ' (RnFV1)
- ' Kelp fly virus ' (KFV)
- ' Kronisk bi lammelsesvirus ' (CBPV)
Satellittvirus
Klassifisering i henhold til Krupovic et al. (2016).
- Familie Sarthroviridae , med slekten Macronovirus
- Familien ikke bestemt
- Slekt albetovirus
- Slekt Aumaivirus
- Slekt Papanivirus
- Slekt Virtovirus
Gruppe V: negativstrengede ssRNA-virus
I gruppe V er det 8 ordrer og mer enn 21 familier. Det er også noen ikke tildelte familier, slekter og virustyper. Siden november 2018 har ICTV disse virusene (med unntak av å ha delta-virus ) forskjellige phyla, og klassene Subphyla tildelt.
-
Phylum (stamme): Negarnaviricota , Subphylum (substam ) : Haploviricotina , klasse : Chunqiuviricetes
-
Bestill muvirales
-
Familie Qinviridae
- Slekten Yingvirus , med arter Wuhan yingvirus
-
Familie Qinviridae
-
Bestill muvirales
- Phylum (stamme): Negarnaviricota , Subphylum (understamme ) : Haploviricotina , klasse: Milneviricetes
- Bestill serpentovirales
- Familie Aspiviridae (foreldet Ophioviridae )
- Slekt ophiovirus
- Familie Aspiviridae (foreldet Ophioviridae )
- Bestill serpentovirales
- Phylum (stamme): Negarnaviricota , Subphylum (understamme ) : Haploviricotina , klasse: Monjiviricetes
- Bestill Jingchuvirales
- Familie Chuviridae
- Slekt Mivirus , med Species Crustacean Mivirus
- Familie Chuviridae
- Bestill Mononegavirales (usegmenterte negativstrengede RNA-virus)
- Artoviridae familie
- Slekt Peropuvirus (tidligere til Nyamiviridae ), med arter Pillworm peropuvirus
- Familie Bornaviridae
- Slekt carbovirus , med arter Southwest carbovirus ( Southwest carpet python virus, SWCPV ) og type arter Queensland carbovirus (Jungle carpet python virus, JCPV)
- Slekt cultervirus , med typen arter Sharpbelly cultervirus
- Slekten Orthobornavirus - en. Borna Disease Virus , viruset fra Bornashs sykdom, med Arts Mammalian 1 orthobornavirus (type) og andre.
- Filoviridae familie
- Familie Lispiviridae
- Slekten Genus Arlivirus (inkludert de tidligere slektene Wastrivirus og Chengivirus / Chengtivirus , med arter Wuchang arlivirus ( Chengtivirus , Tick virus 6 , TCTV-6), Tacheng arlivirus ( Tacheng chengtivirus 6 , TCTV-6) og type arter Lishi arlivirus ( Lishi spider virus 2 , LsSV-2)
- Familie Mymonaviridae
- Slekt Sclerotimonavirus med typen arter Sclerotinia sclerotimonavirus ( Sclerotinia sclerotiorum negativstrenget RNA-virus 1 , SsNSRV-1)
- Familie Nyamiviridae
- Slekten Berhavirus , med arten Echinoderm berhavirus
- Slekt Crustavirus (tidligere Crabvirus ), med Species Wenzhou crustavirus (WzCV-1)
- Slekt Nyavirus , med arter Sierra nevada nyavirus
- Slekt Orinovirus
- Slekt Socyvirus
- Tapwovirus fra slekten
- Familie Paramyxoviridae
- Familie Pneumoviridae
- Familie Rhabdoviridae
- Familie Sunviridae
- Genus sunshine virus (SunCV)
- Familie Xinmoviridae
- Slekt Anphevirus (XcMV)
- ikke tildelt noen familie
- Slekten ' Chengtivirus ', med arten ' Tacheng chengtivirus ' (TcTV-6)
- Slekt ' wastrivirus ', med arten ' Sanxia wastrivirus ' (SxWSV-4)
- ikke tildelt noe kjønn
- Arter ' Taastrup virus ' (TV)
- Artoviridae familie
- Bestill Jingchuvirales
- Phylum (stamme): Negarnaviricota , Subphylum (understamme ) : Haploviricotina , klasse: Yunchangviricetes
- Bestill Goujianvirales
- Familie Yueviridae
- Slekten Yuyuevirus
- Familie Yueviridae
- Bestill Goujianvirales
- Phylum (stamme): Negarnaviricota , Subphylum (substam ) : Haploviricotina , klasse: Ellioviricetes
- bestill Bunyavirales
- Familie Arenaviridae
- Familie Cruliviridae
- Slekt Lincruvirus
- Familie Fimoviridae
- Slekt Emaravirus , med Species European mountain ash ringspot-assosiert virus
- Familie Hantaviridae
- Familie Leishbuviridae
- Familie Mypoviridae
- Slekten Hubavirus
- Familie Nairoviridae
- Slekt Orthonairovirus
- Slekt Shaspivirus
- Slekt Strivavirus
- Familie Peribunyaviridae
- Familie Phasmaviridae
- Orthophasmavirus fra slekten
- Slekt Feravirus (tidligere til Feraviridae )
- Slekt inshuvirus
- Slekten Jonvirus (tidligere kalt Orthojonvirus til Jonviridae )
- Slekt Sawastrivirus (tidligere Wastrivirus ), med type arter Sanxia sawastrivirus ( Sanxia wastrivirus Water strider virus 4 , SxWSV-4)
- Slekt Wuhivirus
- Familie Phenuiviridae
- Slekt Bandavirus (tidligere Banyangvirus ), med Species Dabie bandavirus - syn. SFTS-virus
- Slekt to-virus
- Slekt Goukovirus
- Slekt Horwuvirus
- Slekt Hudivirus
- Slekt Mobuvirus
- Slekt Phasivirus
- Slekt flebovirus
- Slekt pidchovirus
- Slekt Tenuivirus
- Slekten Wubeivirus
- Familie Tospoviridae
- Familie Wupedeviridae
- Slekt wumivirus
- Familie " Lincruviridae " (forslag)
- Slekten " Portunivirus " (forslag) med typen arter Crab portunivirus
- bestill Bunyavirales
- Phylum (stamme): Negarnaviricota , Subphylum (sub- stamme) : Polyploviricotina , klasse: Insthoviricetes
- Bestill Articulavirales
- Familie Amnoonviridae
- Slekt tilapin virus
- Familie Orthomyxoviridae
- Familie Amnoonviridae
- Bestill Articulavirales
- Fylum (stamme): ikke bestemt, underfyll (understamme): ikke bestemt, klasse: ikke bestemt
- Bestilling ikke bestemt
- Familien ikke bestemt
- Slekt Deltavirus , med den eneste arten hepatitt D-virus (HDV)
- Familien ikke bestemt
- Bestilling ikke bestemt
litteratur
- DM Knipe, Peter M. Howley , DE Griffin, (red.): Fields Virology. 5. utgave, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7 .
Individuelle bevis
- ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2 . MSL # 34, mars 2019
- ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 . MSL # 34, februar 2019
- ↑ ICTV: ICTV-taksonomihistorie: Hepatitt delta-virus . EC 51, Berlin, Tyskland, juli 2019; Ratifisering av e-post mars 2020 (MSL # 35)
- ^ R. Sanjuan, MR Nebot, N. Chirico, LM Mansky, R. Belshaw: Viral Mutation Rates . I: Journal of Virology . Volum 84, nr. 19, 2010, ISSN 0022-538X , s. 9733-9748. doi : 10.1128 / JVI.00694-10 .
- W JW Drake, JJ Holland: Mutasjonsrate blant RNA-virus. I: Proceedings of the National Academy of Sciences i USA. 1999, bind 96, nr. 24, s. 13910-13913, PMID 10570172 , PMC 24164 (fri fulltekst).
- ^ A b c Donald W. Klein, Lansing M. Prescott, John Harley: Microbiology . Wm. C. Brown, Dubuque, Iowa 1993, ISBN 0-697-01372-3 .
- ↑ MA Martinez et al.: Quasispecies Dynamics of RNA Virus . I: G. Witzany (red.): Virus: Essential Agents of Life . Springer, 2012, ISBN 978-94-007-4898-9 , s. 21-42.
- ↑ C Lauber, JJ Goeman, C Parkett Mdel, P Thi Nga, EJ Snijder, K Morita, AE Gorbalenya: Fotavtrykket av genomarkitektur i den største genomutvidelsen i RNA-virus . I: PLOS patogener . Volum 9, nr. 7, jul 2013, s. E1003500. doi : 10.1371 / journal.ppat.1003500 .
- ↑ a b D. A. Steinhauer, JJ Holland: Rask utvikling av RNA-virus. I: Årlig gjennomgang av mikrobiologi. 1987, bind 41, s. 409-33, PMID 3318675 .
- ↑ J. Bukh, RH Purcell, RH Miller: Sekvensanalyse av den kjerne-genet av 14 hepatitt C-virus genotyper. I: Proceedings of the National Academy of Sciences . Volum 91, nummer 17, august 1994, s. 8239-8243, PMID 8058787 , PMC 44581 (fri fulltekst).
- ↑ A. Tuplin, DJ Evans, P. Simmonds: En detaljert kartlegging av RNA sekundære strukturer i kjerne og NS5B-kodende region sekvenser fra hepatitt C-virus ved RNase spaltning og nye bioinformatisk prediksjon metoder. I: The Journal of general virology. Volum 85, nr. 10, oktober 2004, s. 3037-3047, doi: 10.1099 / vir.0.80141-0 , PMID 15448367 .
- ↑ EC Holmes: Hva forteller virusutvikling oss om virusets opprinnelse? I: Journal of Virology. 2011, bind 85, nr. 11, s. 5247-51. doi: 10.1128 / JVI.02203-10 , PMID 21450811 , PMC 3094976 (fri fulltekst).
- ↑ MR Patel, M. Emerman, HS Malik: Paleovirology - spøkelser og utdeling av virus tidligere. I: Current Opinion in Virology. 2011, bind 1, nr. 4, s. 304-309, doi: 10.1016 / j.coviro.2011.06.007 , PMID 22003379 , PMC 3190193 (fri fulltekst).
- ↑ AM Dickson, J. Wilusz: Strategies for viral RNA-stabilitet: Leve lenge og godt. I: Trender i genetikk. 2011, bind 27, nr. 7, s. 286-93. doi: 10.1016 / j.tig.2011.04.003 . PMID 21640425 , PMC 3123725 (fri fulltekst).
- ↑ Circulifer tenellus virus 1. På: Virus vert DB .
- ↑ Henxia Xia et al.: Et dsRNA-virus med filamentøs viral partikkel . I: Nature Communications. Volum 8, nr. 168, 2017, doi: 10.1038 / s41467-017-00237-9
- ↑ Spissistilus festinus-virus 1. På: Virusvert DB .
- ↑ SIB: Positive Strand RNA Virus . På: ViralZone .
- ↑ SIB: Avastrovirus . På: ViralZone .
- ↑ SIB: Mamastrovirus . På: ViralZone .
- Oline Karoline dos Anjos, Tatsuya Nagata, Fernando Lucas de Melo: Komplett genomsekvens av en roman Bastrovirus isolert fra rå kloakk . I: Genom kunngjøringer. Oktober 2017, bind 5, nr. 40, s. E01010-17, doi: 10.1128 / genomA.01010-17 , PMC 5629051 (fri fulltekst).
- ↑ SIB: Barnavirus . På: ViralZone .
- ^ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja: Virusverden som et evolusjonært nettverk av virus og kapselfri egoistiske elementer . I: Microbiology and Molecular Biology Reviews. 20. mai 2014, doi: 10.1128 / MMBR.00049-13 , figur 3.
- ↑ Fusariviridae (FAMILIE) . På: UniProt Taxonom .
- ↑ FUSARIVIRIDAE , på: PLANOSPHERE
- ↑ Fusariviridae , om: NCBI Genomes
- ↑ DF Quito-Avila, PM Brannen, WO Cline, PF Harmon, RR Martin: Genetisk karakterisering av Blueberry necrotic ring blotch virus, et nytt RNA-virus med unike genetiske egenskaper . I: Journal of General Virology. Juni 2013, bind 94, del 6, s. 1426-1434, doi: 10.1099 / vir.0.050393-0 , PMID 23486668
- ↑ SIB: Macronovirus . På: ViralZone .
- ↑ D. Qian et al. : Ekstra små viruslignende partikler (XSV) og nodavirus assosiert med hvitaktig muskelsykdom i den gigantiske ferskvanns reke, Macrobrachium rosenbergii . I: Journal of Fish Diseases. Volum 26, nr. 9, september 2003, s. 521-527, PMID 14575370 , doi: 10.1046 / j.1365-2761.2003.00486.x .
- ↑ J. Widada, S. Widada, J. R. Bonami: Kjennetegn ved monocistronisk genomet av ekstra liten virus, en viruslignende partikkel forbundet med Kloreker rosenbergii nodavirus: mulig kandidat for en ny art av satellitt-virus . I: Journal of General Virology. Volum 85, nr. 3, mars 2004, s. 643-646, PMID 14993649 , doi: 10.1099 / vir.0.79777-0
- ↑ MJ Adams, JF Antoniw, J. Kreuze: Virgaviridae: en ny familie av stavformede plantevirus . I: Archives of Virology. . Volum 154, nr. 12, 2009, s. 1967-72. doi : 10.1007 / s00705-009-0506-6 . PMID 19862474 .
- ↑ Xin-Cheng Qin et al.: Et kryssbårent segmentert RNA-virus inneholder genom-segmenter avledet fra usegmenterte virale forfedre . I: PNAS Volum 111, nr. 18, 6. mai 2014, s. 6744-6749, doi: 10.1073 / pnas.1324194111
- ↑ SIB: Dobbeltstrengede RNA-virus . På: ViralZone .
- Ire Claire L. Webster, Ben Longdon, Samuel H. Lewis, Darren J. Obbard: 25 nye virus assosiert med Drosophilidae (Diptera) . I: Evolusjonær bioinformatikk online. 2016, bind 12, tillegg 2, s. 13-25, doi: 10.4137 / EBO.S39454 , PMC PMC4915790 (fri fulltekst), PMID 27375356
- ↑ Carl J. Franz, Guoyan Zhao, Marie-Anne Félix, David Wang: Komplett genom-sekvens av Le Blanc-virus, et tredje Caenorhabditis-matematikkinfeksjonsvirus . I: Journal of Virology. 2012, doi: 10.1128 / JVI.02025-12 , PMID 23043172 , American Society for Microbiology Journals
- Bing Hongbing Jiang, Carl J. Franz, Guang Wu, Hilary Renshaw, Guoyan Zhao, Andrew E. Firth, David Wang: Orsay-virus bruker ribosomalt rammeskift for å uttrykke et nytt protein som er innlemmet i virioner . I: Virologi. 2. februar 2014, bind 450-451, nr. 100, s. 213-221, doi: 10.1016 / j.virol.2013.12.016 , PMC 3969245 (fri fulltekst), PMID 24503084 .
- ↑ Carl J. Franz, Hilary Renshaw, Lise Frezal, Yanfang Jiang, Marie-Anne Félix, David Wang: Orsay, Santeuil og Le Blanc-virus infiserer primært tarmceller i Caenorhabditis nematoder . I: Virologi. Volum 448, 5. januar 2014, s. 255-264, doi: 10.1016 / j.virol.2013.09.024 .
- ↑ Orsay-virus . På: Virusvert DB .
- ↑ J. F. van den Heuvel, H. R. Hummelen, Martin Verbeek, Annette Dullemans: Kjennetegn ved Acyrthosiphon pisum Virus, et nylig identifisert virus som smitter ertebladlusen . I: Journal of Invertebrate Pathology. November / desember 1997, bind 70, nr. 3, s. 169-176, doi: 10.1006 / jipa.1997.4691 , PMID 9367722
- ↑ AJ Gibbs, M. Törrönen, A. M. Mackenzie, J. T. Wood, J. S. Armstrong, H. Kondo, T. Toastmaster, P. L. Keese: en uventet genomet av Chara australis virus. I: Journal of General Virology. November 2011, bind 92, del 11, s. 2679-2690, doi: 10.1099 / vir.0.033852-0 , PMID 21733884 .
- ↑ Nesidiocoris tenuis-virus . På: Virusvert DB .
- ↑ Marion Heller-Dohmen et al.: Nukleotidsekvensen og genomorganisasjonen til Plasmopara halstedii-virus. I: Virology Journal. 2011, bind 8, s. 123, doi: 10.1186 / 1743-422X-8-123 , PMC 3069955 (fri fulltekst), PMID 21410989 .
- ↑ Rosellinia necatrix fusarivirus 1 . På: Virusvert DB .
- ↑ Tare flyvirus . På: Virusvert DB .
- ↑ Eric Dubois et al.: Effekt av pollenfeller på tilbakefall av kronisk bi lammelsesvirus i kolonier med honningbier ( Apis mellifera ) . I: Apidologi. April 2018, bind 49, nr. 2, s. 235–242, doi: 10.1007 / s13592-017-0547-x .
- ↑ M. Krupovic, JH Kuhn, MG Fischer: Et klassifiseringssystem for virofager og satellittvirus . I: Archives of Virology. Volum 161, nr. 1, 2016, s. 233-247, doi: 10.1007 / s00705-015-2622-9 .
- ↑ ICTV: Sarthroviridae . Virustaksonomi: 2019 Versjon EC 51, Berlin, Tyskland, juli 2019 (MSL # 35).
- ↑ SIB: Macronovirus . På: ExPASy: ViralZone .
- ^ Alan Cann: Prinsipper for molekylær virologi . Academic Press, 2011, ISBN 978-0-12-384939-7 .
- ↑ SIB: Negative Strand RNA-virus . På: ViralZone .
- Aya Gaya K. Amarasinghe et al. : Taksonomi av ordren Mononegavirales : oppdatering 2018 . I: Archives of Virology. Volum 163, nr. 8, august 2018, s. 2283-2294.
- ↑ SIB: Orthobornavirus . På: ViralZone .
- ↑ a b c d Claudio L. Afonso et al.: Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2016 . I: Archives of Virology. Volum 161, nr. 8, 1. august 2016, s. 2351-2360.
- ↑ JO Bool et al.: Identifikasjon og delvis karakterisering av Taastrup-virus: en nylig identifisert medlemsart av Mononegavirales . I: Virologi. 5. februar 2004, bind 319, nr. 1, s. 49-59, PMID 14967487 , doi: 10.1016 / j.virol.2003.10.017 .
- TV ICTV Emaravirus . På: talk.ictvonline.org
- ↑ a b Jamie Bojko: Animal dsRNA og ssRNA virus . Forslag til ICTV 15. oktober 2019.