Orthonairovirus

Orthonairovirus
Systematikk
Klassifisering : Virus
Område : Riboviria
Empire : Orthornavirae
Phylum : Negarnaviricota
Understamme : Polyploviricotina
Klasse : Ellioviricetes
Bestilling : Bunyavirales
Familie : Nairoviridae
Sjanger : Orthonairovirus
Taksonomiske egenskaper
Genom : (-) ssRNA segmentert
Baltimore : Gruppe 5
Symmetri : spiralformet
Deksel : tilgjengelig
Vitenskapelig navn
Orthonairovirus
Venstre
NCBI  taksonomi: 1980517
ViralZone ( ExPASy , SIB): 251
ICTV taxon historie: 201900068

Orthonairovirus (tidligere Nairovirus ) er en slekt av virus i familien til Nairoviruses ( Nairoviridae ) fra ordenen Bunyaviruses ( Bunyavirales ), som inkluderer representanter med et genom av segmentert, sirkulær RNA med negativ polaritet . Navnet kommer fra sauersykdommen Nairobi, som påvirker mage-tarmkanalen hos sau og geit. De aller fleste, om ikke alle, av virus i denne slekten er tick- Borne, påvirker virveldyr, og spesielt mennesker.

konstruksjon

De virioner (viruspartikler) av virus av denne slekten er kuleformet (sfærisk). De har en diameter på omtrent 80-120 nm, hvor 50% av vekten tildeles proteiner og 20-30% av vekten til lipider . Ribonukleokapsidet er trådformet og har en lengde på ca. 200-300 nm og en bredde på ca. 2-2,5 nm.

Disse nukleokapsidene består av et enkelt skall med fremspring av glykoproteiner som stikker ut fra overflaten. Disse fremspringene dekker overflaten av virion jevnt og er omtrent 5-10 nm lange.

(a) TEM- bilde av virioner av Krim-Kongo hemorragisk feber-virus (b) Struktur av Orthonairoviridae- viruset: et tverrsnitt av en virion. De spiralformede nukleokapsidene er sirkulære og består hver av et av ssRNA-segmentene (L, stort; M, medium; S, lite), som er innkapslet av N-proteinet og koblet til L-proteinet.


Genom

Genom av Dugbe-viruset (DUGV, art Dugbe orthonairovirus )

Den genomet av virusene i slekten Orthonairovirus består av enkelt-trådet RNA med negativ polaritet . Hele genomet er omtrent 17 100–22 800  nt langt og er delt inn i tre segmenter: stort (L), medium (M) og lite (S). Det store segmentet er omtrent 11.000-1.4400 nt langt og koder for viral polymerase . Midtsegmentet er omtrent 4400-6 300 nt langt og koder for glykoproteinene Gn og Gc. Det lille segmentet er omtrent 1700–2100 nt langt og koder for nukleokapsidproteinet.

Genomet har terminale overflødige sekvenser med sekvensene gjentatt i begge ender. Sekvensene er i 5'-enden: UCUCAAAGA og i 3'-enden: AGAGUAUCU.

Multiplikasjon

Orthonairoviruses fester seg til vertsreseptoren med deres Gn-Gc glykoproteindimer. Viruset blir deretter absorbert i vertscellen via vesikler ( endocytose ). Ribonukleokapsidsegmentene frigjøres i cytoplasmaet (cellevæske), og transkripsjonen begynner. Transkripsjon og replikasjon skjer i cellen, og de nylig syntetiserte virionene frigjøres ved spirende .

overføring

Medlemmer av dette slektviruset infiserer mange forskjellige virveldyr ( Vertebrata ) og smitter av flått . De finnes hvor som helst i verden der leddyr ( leddyr ) som mellomledd (vektorer) og virveldyr ankommer sammen (som verter).

Infeksjon hos mennesker

Så langt har bare fire virus av denne slekten blitt anerkjent som menneskelige patogener:

Et femte virus - Erve-viruset - kan også være patogent for mennesker.

Systematikk

Slekten er konvensjonelt klassifisert i minst ni serogrupper . Hughes og Sakhalin serogrupper ser ut til å være søstergrupper. En fylogenetisk analyse har vist at disse virusene faller inn i to hovedmonofyletiske grupper, som er oppkalt etter flåttvektorer (bærere) i harde ( Ixodidae ) og myke ( Argasidae ). Fossile og fylogenetiske data daterer splittelsen i disse to gruppene mellom 92 og 120 millioner år siden. Dette antyder at Orthonairovirus har vært assosiert med disse flåttene som bærere i over 100 millioner år ( coevolution ). I tillegg danner nairovirus, som overføres av flått av slektene Argas , Carios og Ornithodorus , tre separate monofyletiske linjer, noe som også støtter forslaget om samevolusjon.

Som en slags art har Dugbe orthonairovirus nå erstattet Nairobi sauesykdom orthonairovirus . Følgende klassifisering av arten av slekten Orthonairovirus tilsvarer den fra International Committee on Taxonomy of Virus (ICTV) per november 2018; Forkortelser i henhold til ViralZone er fra 2016; arten er også klassifisert etter sreogrupper. Virusnavnene (underarter osv.) Følger den 9. rapporten fra ICTV og oppdateringen fra 2018:

Khasan-viruset (også Khazan-viruset, KHAV) som tidligere er oppført her, er hovedsakelig plassert i virusslekten Phlebovirus (Uukuniemi serokompleks rundt arten Uukuniemi phlebovirus ).

weblenker

Individuelle bevis

  1. ↑ ICTV Master Species List 2018b.v2 . MSL # 34, mars 2019
  2. ↑ a b ICTV: ICTV taksonomihistorie: Akabane orthobunyavirus , EC 51, Berlin, Tyskland, juli 2019; Ratifisering av e-post mars 2020 (MSL # 35)
  3. ↑ ICTV 9. rapport (2011) Bunyaviridae ( en , html) Hentet 11. februar 2019: "Nairo: fra Nairobi sauesykdom, første rapporterte sykdom forårsaket av medlemsvirus."
  4. ↑ a b c d M.B. Crabtree, R. Sang, BR Miller: Kupe-virus, et nytt virus i familien bunyaviridae, slekten nairovirus, kenya. I: Emerging smittsomme sykdommer. Volum 15, nummer 2, februar 2009, s. 147-154, doi: 10.3201 / eid1502.080851 , PMID 19193256 , PMC 2657624 (fri fulltekst).
  5. ↑ a b c d e f g Nairovirus , på: ViralZone , Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
  6. ↑ a b c d e f g Büchen-Osmond, Cornelia. "00.011.0.03. Nairovirus." ICTVdb Virusbeskrivelser. 25. april 2006. International Committee on Taxonomy of Viruses. 17. april 2009.
  7. Hon E Honig, JC Osborne, ST Nichol: Den høye genetiske variasjonen av virus fra slekten Nairovirus gjenspeiler mangfoldet av deres dominerende flåttverter . I: Virology , 318 (1), 2004, s. 10-16, PMID 14972529
  8. ↑ Hovedarteliste 2018a v1. ICTV , MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2017-utgivelsen. Høst 2018 (MSL # 33)
  9. ↑ Viral sone : ICTV 2016 Master Species List # 31 with Acronyms (Excel XLSX) , SIB Swiss Institute of Bioinformatics
  10. ↑ John PM Clerx, Jordi Casals, David HL Bishop: Structural Characteristics of Nairoviruses (Genus Nairovirus, Bunyaviridae) . I: Journal of General Virology , 55, 1981, s. 165-178, PMID 7299367 .
  11. ↑ ICTV : Negative Sense RNA-virus: Bunyaviridae (2011) , i: 9. rapport fra ICTV (2011)
  12. ↑ Piet Maes, S. Adkind, SV Alkhovsky et al. Taksonomi av størrelsesorden Bunyavirales: andre oppdateringen 2018. I: Arch Virol , Springer, Wien (2019), doi: 10,1007 / s00705-018-04127-3 , ISSN  0304 -8608
  13. ↑ P27317 (NCAP_CCHFV). Nukleoprotein i CCHFV-isolatet C68031. UniProtKB
  14. ↑ DK L'vov et al.: Genetisk karakterisering av Geran-viruset (GERV, Bunyaviridae, Nairovirus, Qalyub-gruppen) isolert fra flåttene Ornithodoros verrucosus Olenev, Zasukhin og Fenyuk, 1934 (Argasidae) samlet i holen til Meriones erythrourus Gray, 1842 i Aserbajdsjan . I: Vopr Virusol. , 2014, 59 (5), S: 13-18, PMID 25895205
  15. ↑ Anbefaling fra ZKBS om risikovurdering av Erve-viruset som donor eller mottakerorganisme for genteknisk arbeid i henhold til § 5 Paragraf 1 GenTSV (PDF) Federal Office for Consumer Protection and Food Safety
  16. ↑ SV Al'khovskiĭ, DK L'vov, MIu Shchelkanov, AM Shchetinin, PG Deriabin, EI Samokhvalov AK, Gitel'man, AG Botikov: Taksonomien til Khasan-viruset (KHAV), en ny representant for flebovirusgenera (Bunyaviridae) , isolert fra flåttene haemaphysalis longicornis (Neumann, 1901) i det maritime territoriet (Russland) . I: Vopr Virusol. , September / oktober 2013, 58 (5), s. 15–18, PMID 24640166 (artikkel på russisk, bare abstrakt på engelsk)
  17. ↑ ICTV: ICTV-taksonomihistorie: Uukuniemi phlebovirus , EC 51, Berlin, Tyskland, juli 2019; Ratifisering av e-post mars 2020 (MSL # 35)