Bunyavirales
Bunyavirales | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rift Valley Fever Virus i Tissues | ||||||||||||||
Systematikk | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
Taksonomiske egenskaper | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
Vitenskapelig navn | ||||||||||||||
Bunyavirales | ||||||||||||||
Venstre | ||||||||||||||
|
De bunyaviruses ( ordre Bunyavirales , tidligere familie Bunyaviridae ) omfatter innhyllet virus med en enkelt-trådet, segmenterte RNA som et genom . RNA-segmentene har overveiende negativ polaritet , f.eks. T. men også ambisense RNA.
De første representantene for bunyavirusene ble isolert på stedet Bunyamwera ( Uganda ), hvorfra ordrenavnet er hentet.
morfologi
De virioner av de bunyaviruses har en rund til uregelmessig form, og, avhengig av slekten, er 80 til 120 nm i størrelse. To 5–10 nm lange glykoprotein pigger (virusproteiner Gn og Gc ) er innebygd i viruskonvolutten . Den kapsid (a ribonukleokapsidpartikkel) er 2 til 2,5 nm tykk og, avhengig av lengden av RNA-tråden, 200-3000 nm lang og med skruelinjeformet symmetri .
Viralgenomet består av ett molekyl hver av tre enkeltstrengede RNAer med negativ eller blandet (dvs. ambisense, +/-) polaritet. De blir referert til som L ( stor ), M ( middels ) og S ( liten ). Endene på de enkelte RNA-segmentene er komplementære, slik at de danner tre ikke-kovalent lukkede ringer (med ringformede kapsider). Sekvensen til disse terminale RNA-seksjonene er sterkt konservert i en slekt. Ved å segmentere genomet er en genetisk omplassering (omplassering) mulig, i likhet med Orthomyxoviridae (f.eks. Influensavirus) , som allerede er vist for noen arter in vitro og in vivo .
Alle bunyaviruses har fire strukturelle proteiner: de to kappeproteinene Gc og Gn (kodet på M-segmentet), nukleokapsidproteinet N (på S-segmentet), og et stort RNA-polymerase -molekyl L (på den L-segmentet). Ytterligere 1–2 ikke-strukturelle proteiner (NSm og NSs) med fortsatt lite forsket funksjon er kodet på M- eller S-segmentet, avhengig av slekten; slekten Hantavirus har ingen andre ikke-strukturelle proteiner.
Biologiske egenskaper
Bunyavirusene (med unntak av Fimoviridae- familien og Tospovirus- slekten ) kan formere seg hos virveldyr og alternativt i insekter . Ved replikering i virveldyrceller oppløser de cellen (cytolytisk) mens ingen eller bare små cytopatologiske forandringer er funnet i insektceller. De enkelte virusartene er veldig nært tilpasset deres virveldyr og insektvert.
De forskjellige virusartene overføres som vektorer av mygg , flått , sandfluer (slekten Phlebotomus ) og andre insekter . Ingen vektorer av denne typen er kjent for hantavirusene; luftbåren overføring og ikke-cytopatogen utholdenhet hos gnagere som verter er beskrevet for dem. Slekten Tospovirus har en spesiell posisjon, da den bare smitter planter (som familien Fimoviridae ) og overføres av frynsete vingefugler ( Thysanoptera ).
Systematikk
I 2016 ble den forrige familien Bunyaviridae delt av Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus (ICTV) i flere familier ( Hantaviridae , Nairoviridae , Peribunyaviridae , Phenuiviridae , Tospoviridae ) av den nylig dannede ordenen Bunyavirales , som også inkluderer Arenaviridae- familien og andre mindre familier av arenavirusene. Systematikken gitt her representerer statusen til november 2018 ( typearter av familiene er merket med '(*)'. Virus (underarter) som tilhører noen utvalgte arter er oppført.
- Familie Peribunyaviridae - de fleste av artene som tidligere tilhørte Bunyaviridae er oppsummert her:
- Slekt urtevirus
-
Slekt Orthobunyavirus med 49 arter, inkludert:
-
Arter Bunyamwera orthobunyavirus (*)
- Underart Bunyamwera Virus (BUNV)
- Batai virus underarter , aka bunyavirus batai (BATV) - influensalignende symptomer og utslett hos mennesker
- Cache Valley Virus (CVV) underart hos sau
- Arter Akabane orthobunyavirus (AkObV)
- Akabane virus (AKAV) underart - hos drøvtyggere
- Underart Sabo Virus (SABOV)
- Underart Tinaroo Virus (TINV)
- Underart Yaba-7-virus (Y7V)
- Arter Anopheles A orthobunyavirus (AAObV)
- Underart Anopheles A virus (ANAV)
- Arter Anopheles B orthobunyavirus (ABObV)
- Underart Anopheles B-virus (ANBV)
- Arter California encefalitt orthobunyavirus (ClObV)
- California-encefalittvirus (CEV) underart
- Inkoo virus (INKV) underart
- Arter Jamestown Canyon orthobunyavirus
- Jamestown Canyon Virus (JCV) underart
- Arter Tahyna orthobunyavirus
- Tahyna virus (TAHV) underart
- Arter Trivittatus orthobunyavirus
- Underart Trivittatus Virus (TVTV)
- Arter La Crosse Encefalitt Virus (aka La Crosse Virus , LACV)
- Arter Melao orthobunyavirus
- Underart Melao-virus (en. Melao-virus, MELV)
- Arter Oropouche orthobunyavirus (OrpObV)
- Underart Oropouche-virus (s. Oropouche-virus, OROV) (+)
- Arter Patois orthobunyavirus (PAObV)
- Underart Patois-virus (en.Patois-virus, PATV)
- Shark River Virus (SRV) underart
- Arter Sathuperi orthobunyavirus (SaObV)
- Sathuperi-virus (SATV) underart
- Schmallenberg-virus (SBV) underart
- Douglas virus underarter (DOUV)
- Arter Shuni orthobunyavirus (ShuObV)
- Underart Shuni Virus (SHUV)
- Aino-virus underarter (AINOV)
- Underart Kaikalur Virus (KAIV)
- Arter Tete orthobunyavirus (TeObV)
- Underart Tete Virus (TETEV)
- Underart Bahig-virus (BAHV)
- Underart Matruh-virus (MTRV)
- Tsuruse virus (TTSUV) underart
- Weldona-virus (WELV) underart
-
Arter Bunyamwera orthobunyavirus (*)
- Slekt Shangavirus
- Arter insekt shangavirus , offisielt Insect shangavirus (*)
- Slekten Tospovirus ( plantevirus , tidligere kalt Orthotospovirus i sin egen familie Tospoviridae ) med 11 arter, inkludert:
- Arter Iris gul flekk tospovirus
- Arter zucchini dødelig klorose tospovirus
- Arter tomatflekket virus , offisielt Tomatflekket vilje tospovirus (*)
- Slekt Shangavirus
- Slekt Tospovirus (tidligere kjent som Orthotospovirus til Tospoviridae )
- Arter tomatbronse flekkvirus - no. Tomatflekket vilje tospovirus
- Familie Arenaviridae - se der for detaljer
- Slekt Mammarenavirus med 35 arter, inkludert:
- Arter lymfocytisk koriomeningittvirus , offisielt lymfocytisk koriomeningitt mammarenavirus (*)
- Arter Lassa-virus , offisielt Lassa mammarenavirus
- Arter Chapare-virus , offisielt Chapare mammarenavirus
- Arter Tacaribe-virus , offisielt Tacaribe mammarenavirus
- Arter Lujo-virus , offisielt Lujo mammarenavirus
- Slekt Hartmanivirus med 1 art:
- Arter Hair Man Institute Snake Virus , offisielt Hair Man hard Manivirus (*)
- Slekt Reptarenavirus med 4 arter inkludert:
- Species University Giessen virus , offisielt Giessen reptarenavirus
- Sperzies slangereptarenavirus 1 , offisielt Golden reptarenavirus (*)
- Slekt Mammarenavirus med 35 arter, inkludert:
- Familie Cruliviridae
-
- Slekt Lincruvirus med 1 art:
- Arter Krepsdyr lincruvirus (*, med stamme Wenling krepsdyrvirus 9, WICV-9)
- Fimoviridae familie (plantevirus)
- Slekt Emaravirus med 9 arter inkludert:
- Arter fiken mosaikkvirus , offisielt fiken mosaikk emaravirus
- Arter Europeisk fjellaskering-assosiert virus (*)
- Slekt Emaravirus med 9 arter inkludert:
- Familie Hantaviridae
- Slekten Orthohantavirus , tidligere Hantavirus , med 35 arter, inkludert:
- Arter Hantaanvirus , offisielt Hantaan orthohantavirus (*) - naturlige infeksjoner spesielt hos gnagere, hvorav noen også kan forårsake blødningsfeber hos mennesker
- Arter Sin Nombre Virus , offisielt Sin Nombre orthohantavirus - naturlige infeksjoner hovedsakelig hos gnagere, hvorav noen også kan forårsake hemorragisk feber hos mennesker
- Genus lån virus med 2 arter
- Arter Longquan lånevirus (*)
- Slekt Mobatvirus med 3 arter
- Arter Nova mobatvirus (*)
- Genus Thottim virus med 2 arter
- Arter Thottopalayam thottimvirus (*)
- Slekten Orthohantavirus , tidligere Hantavirus , med 35 arter, inkludert:
- Familie Mypoviridae
- Slekt Hubavirus med 1 art:
- Arter tusenben hubavirus , offisielt Myriapod hubavirus (*), påvirker tusenben (Myriapoda)
- Slekt Hubavirus med 1 art:
- Familie Nairoviridae med 16 arter
- Slekten Orthonairovirus , tidligere Nairovirus med 15 arter, inkludert:
- Arter Dugbe-virus , offisielt Dugbe orthonairovirus (*)
- Arter Krim-Kongo hemorragisk febervirus (. En Krim-Kongo hemorragisk feber orthonairovirus , CCFV) - Krim-Kongo hemorragisk feber
- Arter Hazara-virus (en. Hazara orthonairovirus , HAZV)
- Arter Nairobi sau sykdomsvirus ( Nairobi sau sykdom orthonairovirus , NDSV)
- Arter Qalyub-virus , offisielt Qalyub orthonairovirus
- Arter Thiafora-virus , offisielt Thiafora orthonairovirus
- Thiafora Virus (no. Thiafora Virus, TFAV)
- Erve-virus (en. Erve-virus, ERVEV) [14]
- Slekt Shaspivirus med 1 art
- Art Spider shaspivirus (*)
- Slekt Strivavirus med 1 art
- Arter Strider striwavirus (*)
- Slekten Orthonairovirus , tidligere Nairovirus med 15 arter, inkludert:
- Familie Phasmaviridae
- Slekt Orthophasmavirus med 5 arter inkludert:
- Arter Kigluaik phantom virus , offisielt Kigluaik phantom orthophasmavirus (*)
- Slekt Feravirus (tidligere i egen familie Feraviridae ) med 1 art:
- Arter Ferak-virus , offisielt Ferak feravirus (*)
- Slekt Inshuvirus med 1 art
- Arter Insekt inshuvirus (*)
- Slekten Jonvirus (tidligere kalt Orthojonvirus til egen familie Jonviridae ) med 1 art, inkludert:
- Arter Jonchet-virus , offisielt Jonchet jonvirus , foreldet Jonchet orthojonvirus (*)
- Slekt Sawastrivirus (tidligere Wastrivirus ), med type arter Sanxia sawastrivirus
- Arter Sanxia wastrivirus (alias Water strider virus 4 , SxWSV-4)
- Slekt Wuhivirus med 1 art
- Arter Insekt wuhivirus (*)
- Slekt Orthophasmavirus med 5 arter inkludert:
- Familie Phenuiviridae
- Slekt Bandavirus (tidligere Banyang-virus )
- Arter Dabie bandavirus (tidligere Huaiyangshan banyangvirus )
- Underart SFTS-virus (SFTSV)
- Bhanja-virus (BHAV) underart
- Arter " Heartland banyangvirus "
- Heartland virus (HRTV) underart
- Arter Dabie bandavirus (tidligere Huaiyangshan banyangvirus )
- Slekt Beidivirus med 1 art
- Slekt Goukovirus med 3 arter
- Slekt Horwuvirus med 1 art
- Slekt Hudivirus med 1 art
- Slekt Hudovirus med 1 art
- Slekt Mobuvirus med 1 art
- Slekt Phasivirus med 4 arter
- Slekt flebovirus med 10 arter inkludert:
- Arter Rift Valley Fever- virus , offisielt Rift Valley feber Phlebovirus (*)
- Arter sand fly feber virus , offisielt Sandfly feber Napoli phlebovirus
- Toscana virus underarter
- Arter Uukuniemi-virus , offisielt Uukuniemi phlebovirus
- Slekt pidchovirus med 1 art
- Slekt Tenuivirus med 6 arter
- Slekt Wubeivirus med 2 arter
- Slekt Bandavirus (tidligere Banyang-virus )
- Familie Wupedeviridae
- Slekt wumivirus med 1 art:
- Arter bipedal wumivirus , offisielt Millipede wumivirus (*), angriper bipedal bipedes (Diplopoda, engelsk tusenbein )
- Slekt wumivirus med 1 art:
- Familie " Lincruviridae " (forslag)
-
- Slekten " Portunivirus " (forslag)
- Crab portunivirus (*) med stamme European shore crab virus 1 (alias Carcinus maenas Portunibunyavirus 1, EscV-1) - fjern slektning av Wēnlǐng krepsdyrvirus 9 (WICV-9), Cruliviridae
I tillegg er det antall virusarter som er blitt foreslått for ordren Bunyavirales, men som ennå ikke er tildelt en slekt.
Individuelle bevis
- ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL # 34, feb.2019
- ↑ a b ICTV: ICTV taksonomihistorie: Akabane orthobunyavirus , EC 51, Berlin, Tyskland, juli 2019; Ratifisering av e-post mars 2020 (MSL # 35)
- ↑ ViralZone: ICTV 2016 Master Species List # 31 with Acronyms, (Excel XLSX) , SIB Swiss Institute of Bioinformatics
- ↑ SIB: Orthotospovirus , på: ViralZone
- TV ICTV Emaravirus
- ↑ Claudio L. Afonso et al. : Taksonomi av rekkefølgen Mononegavirales: oppdatering 2016 , i: Archives of Virology, bind 161, nr. 8, 1. august 2016, s. 2351-2360
- ↑ a b Piet Maes et al. : Utvidelse av ordren Bunyavirales , ICTV Technical Report, juni 2018, doi: 10.13140 / RG.2.2.25861.40163
- ↑ a b Et alternativt forslag var tidligere: Arts ' Tick-borne phlebovirus ' (TBPV) av slekten Phlebovirus ; Shu Shen, Xiaomei Duan, Bo Wang, Liying Zhu, Yanfang Zhang, Jingyuan Zhang, Jun Wang, Tao Luo, Chun Kou, Dan Liu, Chuanwei Lv, Lei Zhang, Chenchen Chang, Zhengyuan Su, Shuang Tang, Jie Qiao, Abulimiti Moming , Cheng Wang, Abulikemu Abudurexiti, Hualin Wang, Zhihong Hu, Yujiang Zhang, Surong Sun, Fei Deng: Et nytt flåttbårent flebovirus, nært beslektet med alvorlig feber med trombocytopeni syndromvirus og hjertelandvirus, er et potensielt patogen , i: Natur : Emerging Microbes & Infections, Volume 7, Artnr. 95, 25. mai 2018, doi : 10.1038 / s41426-018-0093-2
- ↑ SIB: [1] , på: ViralZone
- ↑ a b Jamie Bojko: Animal dsRNA og ssRNA-virus , forslag 2020.002MNv1.Portunivirus til ICTV fra 15. oktober 2019 (via WebArchive fra 10. november 2019)
litteratur
- CM Fauquet, MA Mayo et al.: Åttende rapport fra International Committee on Taxonomy of Virus , London, San Diego, 2004
- David M. Knipe, Peter M. Howley, et al. (red.): Fields 'Virology, 4. utgave, Philadelphia 2001