Negarnaviricota

Negarnaviricota
Negarnaviricota montage.jpg

En montasje av TEM-bilder av
noen virus fra
Phylum Negarnaviricota (ikke i målestokk).
Fra venstre til høyre, topp til bunn:
Zaire Ebolavirus , Sin Nombre Orthohantavirus , Respiratory Syncytial Virus (en. Human orthopneu- movirus ), Hendra Henipa virus , et rhabdovirus (uspesifisert), meslinger morbillivirus .


Systematikk
Klassifisering : Virus
Rike : Riboviria
Empire : Orthornavirae
Phylum : Negarnaviricota
Taksonomiske egenskaper
Genom : (-) ss RNA
Baltimore : Gruppe 5
Vitenskapelig navn
Negarnaviricota
Kort navn
NSV
Venstre
NCBI  taksonomi: 2497569
ICTV taxon historie: 201906016

Den Phylum (stamme) Negarnaviricota (noen ganger engelsk Negative trådet RNA virus , NSVs heter) omfatter alle negativsträngigen virus med en enkelt-trådet RNA- genom i negativ-tråd orientering ( -nega ) med unntak av delta-virus ( hepatitt D-virus ). Den er delt inn i subphyla ( understammer ) Haploviricotina og Polyploviricotina . Fylum ble etablert 4. november 2018 som den eneste virusfylen til dags dato av Den internasjonale komiteen for taxonomi av virus (ICTV), men den inkluderer ikke alle virusene langt siden de fleste av dem (ennå) ikke har fått tildelt en fylle.

Systematikk

Internt system

Den taksonomi av den Negarnaviricota opp til rangeringen av orden (og noen utvalgte familier ) er som følger:

  • Subphylum Haploviricotina
  • Slekt Mivirus , med arter krepsdyr Mivirus
  • Subphylum Polyploviricotina

Når det gjelder omfanget, inkluderer fylum Negarnaviricota alle virus som Koonin et al. (2015) hadde foreslått en slektningsgruppe Negative-streng RNA-virus , selv om strukturen publisert av ICTV (og bare delvis gjengitt ovenfor) ikke alltid samsvarer i detalj med slektstreet der.

Eksternt system

I 2015 mistenkte Koonin et al. At familiegruppen Negative-streng RNA-virus ( dvs. dagens Phylum Negarnaviricota ) , som de postulerte den gang , kunne stamme fra familien Flaviviridae . Sammen med Tombusviridae (som en foreslått søstergruppe av Flaviviridae ) har de erklært at de er medlemmer av supergruppen "Flavivirus-lignende superfamilie" postulert av dem. For picornavirales og tymovirales har de foreslått lignende supergrupper ("picornavirus-lignende superfamilie" eller "alphavirus-lignende superfamily") på samme tidspunkt sammen med andre RNA-virusfamilier.

Shi et al (2016) refererer tilsvarende til det videre forholdet mellom Flaviviridae som " Flavi-lignende virus ".

Individuelle bevis

  1. ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL # 34, feb.2019
  2. ↑ a b ICTV: ICTV taksonomihistorie: Akabane orthobunyavirus , EC 51, Berlin, Tyskland, juli 2019; Ratifisering av e-post mars 2020 (MSL # 35)
  3. ↑ a b ICTV Master Species List 2018a v1 . Hentet 4. november 2018.
  4. ↑ Jens H. Kuhn: Megataxonomy av Negautve-sense RNA virus: phylum Negarnaviricota , NIH / NIAID / DCR / Integrated Research Facility ved Fort Detrick, Frederick, MD, USA
  5. Aya Gaya K. Amarasinghe et al. : Taksonomi av ordren Mononegavirales : oppdatering 2018 , Archives of Virology, bind 163, nr. 8, august 2018, s. 2283-2294
  6. ^ A b Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity , in: Virology from May 2015; 479-480. 2-25, Epub 12. mars 2015, PMC 5898234 (fulltekst), PMID 25771806
  7. ↑ Siden denne supergruppen (referert til av forfatterne engelsk superfamilie ) inneholder et fylum med Nagarnaviricota , må rangene deres være høyere enn dette og skal ikke forstås som en superfamilie . Rangeringer høyere enn orden (f.eks. Phylum) ble ikke spesifisert av ICTV på tidspunktet for 2015-arbeidet.
  8. ↑ Mang Shi, Xian-Dan Lin, Nikos Vasilakis, Jun-Hua Tian, ​​Ci-Xiu Li, Liang-Jun Chen, Gillian Eastwood, Xiu-Nian Diao, Ming-Hui Chen, Xiao Chen, Xin-Cheng Qin, Steven G. Widen, Thomas G Wood, Robert B Tesh, Jianguo Xu, Edward C Holmes, Yong-Zhen Zhang: Divergerende virus oppdaget i leddyr og virveldyr Reviderer evolusjonær historie til Flaviviridae og relaterte virus . I: Journal of Virology . 90, nr. 2, 2016, s. 659-69. doi : 10.1128 / JVI.02036-15 . PMID 26491167 . PMC 4702705 (fulltekst).

litteratur