Fiersviridae
| Fiersviridae | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Bakteriofag MS2 kapsid | ||||||||||||||
| Systematikk | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Taksonomiske egenskaper | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
| Vitenskapelig navn | ||||||||||||||
| Fiersviridae | ||||||||||||||
| Venstre | ||||||||||||||
|
Den Fiersviridae (foreldet: Leviviridae ) er en familie av virus som fungerer som bakteriofager for å angripe forskjellige bakterier , deriblant enterobakterier , Caulobacter , Pseudomonas og Acinetobacter . Den taksonomi av den internasjonale komiteen på Taksonomi av virus (ICTV) per november 2018 gjenkjenner to slekter , hver med to arter .
De er små RNA-virus med et lineært, enkeltstrenget RNA - genom med positiv polaritet , som bare koder for fire proteiner . Alle fager i denne familien krever bakteriell pili for å binde seg til og infisere vertscellen (bakteriecellen).
I mars 2021 ble det foreslått å flytte disse virusene fra forrige klasse Allassoviricetes til en ny klasse Leviviricetes . ICTV overholdt dette i nummer 36 av sin Master Species List (MSL) 2021, og omdøpte samtidig ordren (fra Levivirales til Norzivirales ) og familien (fra Leviviridae til Fersviridae ). Samtidig har antall slekter økt fra to til 185.
Systematikk
Eksternt system
Familien er medlem av ordenen Norzivirales (tidligere Levivirales ). De fleste representantene for denne ordren ble funnet av metagenomics . Følgende familier tilhører dette:
- Familie Atkinsviridae
- Familie Duinviridae
- Familie Fiersviridae (foreldet Leviviridae )
- Familie Solspiviridae
Internt system
Med ICTV fra juni 2021 har familien hundre og åttifem (185) slekter. Disse er - med et utvalg av arter (arter):
- Familie Fiersviridae (foreldet Leviviridae )
- Slekt Adahivirus
- Slekten Aldhiuvirus
- Slekt amubhivirus
- Slekten Andhasavirus
- Slekten Andhaxevirus
- Slekt anedhivirus
- Slekt Apukhovirus
- Slekt Ashucavirus
- Slekten Bahscuvirus
- Slekt Bathrivirus
- Slekten Behevivirus
- Slekt Behlfluvirus
- Slekten Bertavirus
- Slekt Bihdovirus
- Slekt Bisdanovirus
- Slekt Blafavirus
- Slekt Bohnovirus
- Slekt Bohwovirus
- Slekt Boloprevirus
- Slekt Boschuvirus
- Slekt Breudwovirus
- Slekt Brudgevirus
- Slekt Buhdavirus
- Slekt Cahdavirus
- Slekt Cahrpivirus
- Slekten Caloevirus
- Slekt Cauhl divirus
- Slekt Cehakivirus
- Slekt Chaedoavirus
- Slekt Chahsmivirus
- Slekt Chihyovirus
- Slekt Chobevirus
- Slekt Choctavirus
- Slekt Cintrevirus
- Slekt Condavirus
- Slekt Creshivirus
- Slekt Cunavirus
- Slekten Dahmuvirus
- Slekt darnbovirus
- Slekt Decadevirus
- Slekt dehcevirus
- Slekt denfovirus
- Slekt Depandovirus
- Slekt Dihsdivirus
- Genus jackdaw virus
- Slekt Dosmizivirus
- Slekten Duhcivirus
- Slekt Emesvirus (tidligere Levivirus )
- Arter Emesvirus japonicum (foreldet: Escherichia virus BZ13 )
- Arter Emesvirus zinderi (foreldet Escherichia virus MS2 , Enterobacteriophage MS2 , Coliphage MS2 )
- Arter Emesvirus piscicola
- Slekt Empivirus
- Slekt Fagihyuvirus
- Slekten Febihevirus
- Slekten Fiyodovirus
- Slekt gahline virus
- Slekt Gahlovirus
- Slekten Garovuvirus
- Genus hjerne virus
- Slekten Glincaevirus
- Slekt Glyciruvirus
- Slekt ku virus
- Slekt Gorodievirus
- Slekten Grendvuvirus
- Slekt Gunawavirus
- Slekt Hagavirus
- Slekten Hahdsevirus
- Slekt Halcale-virus
- Slekt Hihdivirus
- Slekt Hukohnovirus
- Slekt Icumivirus
- Slekten Ideskevirus
- Slekt Imeberivirus
- Slekt Ineyimevirus
- Slekten Iruqauvirus
- Slekt ishugivirus
- Slekt Jiesduavirus
- Slekt Johnovirus
- Slekt Jupbe-virus
- Slekt kahfsdivirus
- Slekt keghovirus
- Slekt Kehmevirus
- Slekt Kemicevirus
- Slekt Kenamavirus
- Slekten Kihryuvirus
- Slekt Kirnavirus
- Slekt Kiwsmaevirus
- Slekt Konkivirus
- Slekt kowinovirus
- Slekt cow shovirus
- Slekten Lohmavirus
- Slekt Loslovirus
- Slekt Lulohlevirus
- Slekt Luthavirus
- Slekten Mahqeavirus
- Slekt Mahraivirus
- Slekt Manohtivirus
- Slekt manrohovirus
- Slekt Martavirus
- Slekt Meblowovirus
- Slekt Mehraxmevirus
- Slekt Mekintivirus
- Slekt metovirus
- Slekt Mihkrovirus
- Slekt Mintuvirus
- Slekt monamovirus
- Slekt Mucrahivirus
- Slekt muyegivirus
- Slekten Nadsece-virus
- Slekten Nahjiuvirus
- Slekten Nahrudavirus
- Slekten Nahsuvirus
- Slekt Niankuvirus
- Slekt Nihucivirus
- Slekt Niuhvovirus
- Slekten Noehsivirus
- Slekten Nuihimevirus
- Slekten Oceshuvirus
- Slekten Olmsdivirus
- Slekten Omohevirus
- Slekt Onohmuvirus
- Slekt Opdykovirus
- Slekt Osigowavirus
- Slekt Owenocuvirus
- Slekt oxychlovirus
- Slekt Palsdevirus
- Slekt Paysduvirus
- Slekten Pehohrivirus
- Slekten Pehsaduvirus
- Slekt Pepevirus
- Slekt Perrunavirus
- Slekt Philtcovirus
- Slekt Phobpsivirus
- Slekt Phulivirus
- Slekt Piponevirus
- Slekt Pipunevirus
- Slekt Pohle-virus
- Slekt pohtamavirus
- Slekt Poncivirus
- Slekt Psehatovirus
- Slekt psimevirus
- Slekt pudlivirus
- Slekt Qubevirus (tidligere Allolevivirus )
- Arter Qubevirus durum (foreldet Escherichia virus Qbeta , Enterobacteriophage Qbeta , Coliphage Qβ )
- Arter Qubevirus faecium (foreldet Escherichia virus FI )
- Slekt Radbaivirus
- Slekten Rehihmevirus
- Slekt Rehudzo-virus
- Slekten Rusvolovirus
- Slekt Scuadavirus
- Slekt Sehcovirus
- Genus visuell povirus
- Slekt Seybrovirus
- Slekt Shebanavirus
- Slekt Shihovirus
- Slekt Sholavirus
- Slekten Shomudavirus
- Slekt Shuravirus
- Slekten Sincthavirus
- Slekten Skhembuvirus
- Slekt Smudhfivirus
- Slekt Soetuvirus
- Slekt Sphonivirus
- Slekt stjeler mavirus
- Slekten Swihdzovirus
- Slekt Tahluvirus
- Slekt tapikevirus
- Slekt Teciucevirus
- Slekten Tehdravirus
- Slekten Tehnexuvirus
- Slekt Thidevirus
- Slekt Thiwvovirus
- Slekt Thiyevirus
- Slekt Thobivirus
- Slekten Ticahravirus
- Slekt Tohvovirus
- Slekten Trucevirus
- Slekten Ureyisuvirus
- Slekten Ushumevirus
- Slekt Vinehtivirus
- Slekten Vohsuavirus
- Slekten Wahtavirus
- Slekt Whietlevirus
- Slekt Whilavirus
- Slekten Wohudhevirus
- Slekt Vyahn-virus
- Slekt Yahnavirus
- Slekt Yemegivirus
- Genus Yohcade virus
- Slekten Yuhrihovirus
konstruksjon
(a) Enterobacteriaphage MS2 (slekt Levivirus )
(b) Enterobacteriaphage Qß (slekt Allolevivirus )
De viruspartikler (virioner) av Leviviridae ikke er omhyllet med tyveflatede eller sfæriske geometrier og med en triangulering nummer (symmetri) T = 3 . Diameteren er ca 26 nm. Genomet er lineært og ikke segmentert med en størrelse på ca. 4000 nukleotidbaser . Den koder for 4 proteiner .
Handlingsmåte
Etter å ha kommet inn i vertscellen, finner replikasjon sted i modellen for RNA-virus med positiv polaritet. Viruset kommer ut av vertscellen gjennom bakteriell lysis .
De fire kodede proteinene er kappeproteinet (for kapsiden ), replikasen , modningsproteinet (A-protein) og lyseproteinet, de tilknyttede gener kalles cp , rep , mat og lys .
Individuelle bevis
- ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL # 34, feb.2019
- ↑ a b ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , Ny MSL inkludert alle taxaoppdateringer siden 2018b-utgivelsen, mars 2020 (MSL # 35)
- ↑ a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1 , New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL # 36)
- ↑ a b c Viral Zone . EXPASy. Hentet 19. desember 2018.
- ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2018a v1 . Hentet 19. desember 2018.
- ↑ a b JP Bollback, JP Huelsenbeck: fylogeni, genomutvikling og vertsspesifisitet av enkeltstrenget RNA-bakteriofag (familie Leviviridae). . I: Journal of Molecular Evolution . 52, nr. 2, februar 2001, s. 117-28. doi : 10.1007 / s002390010140 . PMID 11231891 .
- ^ Deretter Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy , i: MDPI Viruses Volume 13, No. 3, Section Bacterial Virus, 18. mars 2021, 506, doi: 10.3390 / v13030506
- Call J. Callanan, S. R. Stockdale, E. M. Adriaenssens, J. H. Kuhn: Gi nytt navn til en klasse (Leviviricetes - tidligere Allassoviricetes), endre navn på en ordre (Norzivirales - tidligere Levivirales), opprett en ny ordre (Timlovirales), og utvid klassen til totalt seks familier, 420 slekter og 883 arter . I: Researchgate . Januar 2021. doi : 10.13140 / RG.2.2.25363.40481 .
- ↑ SIB: Levivirus , på: ViralZone
- ↑ SIB: Allolevivirus , på: ViralZone