CRISPR / Cpf1-metoden
Den CRISPR / Cpf1 metode ( engelsk Gruppert regelmessig avstandsplasserte Kort palindromisk Gjentar fra Prevotella og Francisella ) er en biokjemisk metode for generering av genetisk modifiserte organismer .
egenskaper
CRISPR / Cpf1-systemet kommer fra - som CRISPR / Cas9-systemet og CRISPR / Cas12b-systemet - en adaptiv antiviral forsvarsmekanisme, CRISPR , men fra slektene Prevotella og Francisella . Som med denne har metoder for å bruke systemet som et verktøy for bioteknologisk forskning for ulike organismer blitt og blir utviklet på grunnlag av systemet.
Sammenligning med Cas9
Sammenlignet med CRISPR / Cas-systemet er endonukleasen Cpf1 (også kalt Cas12a) som brukes i CRISPR / Cpf1-systemet, et mindre enzym som bare krever et RNA som en mal (ingen tracrRNA ) for å kutte dobbeltstrenget DNA på et bestemt punkt. Videre har Cpf1 et annet grensesnitt og skaper et baseoverheng på en av de to DNA-strengene ( klebrig ende ), som letter ligering . På grunn av det opprettede overhenget med klebrig ende kan orienteringen av et DNA som skal settes inn kontrolleres med Cpf1, mens det innsatte DNA med Cas9 har feil retning i halvparten av innsettingen. Når det gjelder forskjellige applikasjoner av CRISPR / Cas-systemet, er det også søkt om patenter for Cpf1-baserte genommanipulasjoner .
Forskjeller mellom Cas9, Cpf1 og Cas12b
| eiendom | Cas9 | Cpf1 (Cas12a) | Cas12b |
|---|---|---|---|
| struktur | 2 RNA kreves | 1 RNA kreves (ingen tracrRNA ) | 2 RNA kreves |
| Overheng | ingen (stump ende) | klebrig ende | klebrig ende |
| grensesnitt | proksimal til gjenkjenningssekvensen | distalt til gjenkjenningssekvensen | distalt til gjenkjenningssekvensen |
| Målsekvens | G-rik PAM | T-rik PAM | T-rik PAM |
| Celletype | delende celler | hvileceller | ukjent |
weblenker
- Heidi Ledford: Verktøy for genetisk manipulasjon - genteknikk: CRISPR endrer alt . I: Spectrum of Science . fra 24. juni 2015.
Individuelle bevis
- ^ R. Sorek, V. Kunin, P. Hugenholtz: CRISPR - et utbredt system som gir ervervet motstand mot fager i bakterier og archaea. I: Naturomtaler. Mikrobiologi. Volum 6, nummer 3, mars 2008, s. 181-186, ISSN 1740-1534 , doi : 10.1038 / nrmicro1793 , PMID 18157154 .
- ↑ a b Winston X. Yan, Pratyusha Hunnewell, Lauren E. Alfonse, Jason M. Carte, Elise Keston-Smith, Shanmugapriya Sothiselvam, Anthony J. Garrity, Shaorong Chong, Kira S. Makarova, Eugene V. Koonin, David R. Cheng, David A. Scott: Funksjonelt forskjellige type CRISPR-Cas-systemer. I: Vitenskap. 363, 2019, s. 88, doi : 10.1126 / science.aav7271 .
- ↑ a b c d Heidi Ledford: Alternativt CRISPR-system kan forbedre genomredigering. I: Natur. 526, 2015, s. 17, doi : 10.1038 / nature.2015.18432 .
- ^ Til og med CRISPR: En ny måte å redigere DNA på kan gi raskere utvikling av genteknologi . I: Economist , 3. oktober 2015.
- ↑ EPO gir CRISPR patent til Broad. (Ikke lenger tilgjengelig online.) I: transkript.de . 28. februar 2017, arkivert fra originalen 12. mars 2017 ; åpnet 9. mars 2017 . Info: Arkivkoblingen ble satt inn automatisk og har ennå ikke blitt sjekket. Vennligst sjekk originalen og arkivlenken i henhold til instruksjonene, og fjern deretter denne meldingen.
- ↑ cas12b - CRISPR-assosiert endonuklease Cas12b - Alicyclobacillus acidoterrestris (stamme ATCC 49025 / DSM 3922 / CIP 106132 / NCIMB 13137 / GD3B) - cas12b-gen. I: uniprot.org. 16. oktober 2013, åpnet 24. januar 2019 .
