Stamme (biologi)

Hierarki av taksonomiske nivåer (uten mellomnivåer)

I biologiske systematikk, den stammen er en hierarkisk rangering av den taksonomi . En koffert i denne forstand er også kalt en phylum (flertall phyla ). I eukaryoter (levende vesener hvis celler har en kjerne ) er hver stamme underlagt et rike . I kontrast er ikke prokaryoter ( bakterier og archaea ) delt inn i riker, men direkte i stammer.

Med prokaryoter blir "stamme" også brukt i en annen, ikke-taksonomisk betydning, siden forskjellige linjer innenfor en art også blir referert til som stammer.

Sil som en taksonomisk rang i eukaryoter

I domenet til eukaryoter (Eukaryota) er stammen et hierarkisk nivå mellom imperium og klasse . Hvert levende vesen som beskrives, bør tildeles en stamme, så bagasjerommet tilhører de kategoriske rekkene . Noen ganger er den delt inn i understammer ( Subphyla , entall: Subphylum ). Eksempel: Virveldyrene er en understamme i akkordatenes stamme . Flere stammer er i noen tilfeller for overbelastede eller Superphylum oppsummert.

botanikk

I botanikk og mykologi , den synonym avdeling ( engelsk divisjon , Latin Divisio er) tillatt i tillegg til stammen . Navneslutt er standardisert i botanikk og mykologi, navnene ender i botanikk på -phyta, i mykologi på -mycota. Tradisjonelt skilles det mellom ni stammer av alger, åtte av de høyere plantene ( Embryophyta ) og fire av soppene. Ifølge nyere funn er denne klassifiseringen stort sett foreldet, men brukes fortsatt på mange måter.

zoologi

Grunnleggeren av moderne taksonomi, Carl von Linné , delte dyreriket (regnum) (Animalia) hierarkisk i klasser (classis), ordrer (ordo), slekt (slekt) og art (art). Den franske anatom og naturforskeren Georges Cuvier forutsett fire høyest rangerte avdelinger i dyreriket, som han kalte embranchements og som omtrent tilsvarer Linnés klasser: Vertébrés ( virveldyr ), Mollusques ( bløtdyr ), Articulés ( dyr artikulert ) og Radiaires (" ray dyr "); Først da følger Cuvier- klassene .

Begrepet stamme ( Latin phylum ) som høyeste rang og navnet ble først introdusert av den tyske zoologen Ernst Haeckel . Haeckel navngir fem stammer: coelenterates, pigghuder, leddyr, bløtdyr, virveldyr. Svampene (Spongiae) ble anerkjent av ham, men ikke tilskrevet dyreriket, men protistene . For Haeckel var stammene fundamentalt forskjellige typer organisasjoner, som hver kan spores tilbake til en vanlig stammeart.

Som et resultat av kunnskapsutviklingen innen zoologi er rundt tretti stammer for tiden differensiert (se systematikk for flercellede dyr ); Det er vanskelig å klassifisere protistene . Tradisjonelt oppfattet som en enkelt stamme, er de for tiden delt inn i et antall stammer. For eksempel utpekte Thomas Cavalier-Smith 18 stammer av protister og oppsummerte dem som et imperium under navnet Protozoa .

I vitenskapen er to klassifikasjonsordninger for tiden i bruk side om side. I tillegg til den klassiske systematikken, som kan spores tilbake til Linné , har fylogenetisk systematikk eller kladistikk grunnlagt av Willi Hennig dukket opp . I det fylogenetiske systemet, bør alle enhetene være basert på fellesskap av avstamning og inkludere alle etterkommere av en vanlig foreldreart ( holofyletiske enheter). De suksessive splittelsene resulterer i en trestruktur. Grupper som også går tilbake til en vanlig foreldreart ( dvs. er monofyletiske ), men som ikke inkluderer alle deres etterkommere, kalles parafyletisk av ham . Parafyletiske enheter er tillatt i det klassiske systemet, men ikke i det fylogenetiske systemet. Som et resultat av denne reformen ble aspektet av felles form og organisering som det klassiske begrepet baserte seg på, falmet ut i bakgrunnen. De fleste av de morfologisk baserte stammene viste seg å være holofyletiske. Men: I følge dette systemet er den vanlige planen ikke lenger grunnleggende for den systematiske klassifiseringen, passende definerte enheter må forlates hvis de ikke er holofyletiske, selv om taxaene oppsummert på denne måten lett kunne gjenkjennes som å høre sammen på grunn av deres felles blåkopi.

Generelt sett brukes den klassiske dyrefylen mest som organisatoriske enheter i fylogenetisk system, men de tilsvarer ikke lenger en bestemt, definert rang som i det klassiske systemet, så de trenger ikke nødvendigvis å være av samme rang. Noen systematikere trekker konklusjonen om at stammer, som alle andre rekker i det klassiske systemet, er rent vilkårlige enheter som bør gis opp til fordel for et rent søstergruppeforhold . De fleste systematikere fortsetter imidlertid å bruke stilker, som de andre klassene i det klassiske systemet. Dette resulterer ikke i en motsetning til fylogenetisk system, så lenge den (unødvendige) tilstanden bortfaller at søstergruppene må være av samme rang. Den videre bruken har fordelen at med en forkortet betegnelse kan mye mer informasjon formidles enn med det fullstendig ikke-illustrerende, rent basert på søstergruppesystem med dets endeløse rekkefølge av mellomliggende grupper. I tillegg blir sammenligninger, for eksempel antall arter, lettere.

Imidlertid er denne bruken av begrepet kun ment for å lette kommunikasjon om organismer. Hvis det kan vises at en gruppe arter som tidligere ble ansett som en stamme, danner en undergruppe av en annen taxon som betraktes som en stamme, blir det ikke lenger referert til som en stamme for å unngå misforståelser. Et nyere eksempel er siboglinidae : Tidligere ble de ansett som vanlige Pogonophora nå enn familien Siboglinidae som roten til annelider (Annelida).

Som en koffert eller fylle blir en gruppe organismer med lignende form eller lignende " blåkopi " vanligvis oppsummert for øyeblikket, hvis dette er så forskjellig fra medlemmene i andre stammer at de ikke begge kan samles på en felles basis mønster. Med noen få unntak kan de nåværende stammene spores tilbake til Kambrium på grunnlag av fossile funn .

Taxa i rang av en stamme (og alle andre taxa over superfamilien ) er ikke underlagt reglene i ICZN . Dette betyr at reglene i koden ikke trenger å brukes på navnene på stammene. Dette gjelder særlig reglene for gyldigheten (tilgjengeligheten) av navnene og prioritetsprinsippet, ifølge hvilket det første foreslåtte / eldste navnet skal brukes hvis flere navn er tilgjengelige for samme gruppe. Navnene på stammene er derfor mer eller mindre faste ved konsensus av de involverte ekspertene, som bruker et bestemt navn - eller ikke. I praksis prioriterer de fleste forskere også stammene og bruker de tradisjonelle navnene selv når de omdefinerer de involverte taksene, f.eks. B. skjære ut taxa fra dem eller legge til andre. Avvik forekommer hovedsakelig med tilhengere av PhyloCode . De fleste forskere ignorerer dette nylig foreslåtte regelsettet.

Stamme som en taksonomisk rang blant prokaryoter

For domenene bakterier (bakterier) og Archaea (Archaea), er det rang nivå stammen (Rekke) direkte under det for domenet, slik at disse to områdene er delt inn i phyla. Antallet stammer er kontroversielt i elva og innen vitenskap; antallet har økt merkbart de siste årene. Det antas for tiden at det er minst 35 bakteriestammer og 18 stammer av archaea.

Stammer i en mikrobe eller virusart

Ingen taksonomisk rang er som stammer ( engelske stammer ) utpekt fra å komme ungslinien av mikrosopp, protister , prokaryoter og virus . Disse kulturstammene ( ren kultur ) brukes blant annet som en nomenklasjonstype ( type stamme ) for å definere arter (arter) og underarter (underarter). En stamme i denne forstand består av en klon , fordi det er en aseksuell reproduksjon generert befolkning er.

Et eksempel på en stamme i denne forstand er bakteriestammen Rhodococcus jostii RHA1 innen bakteriearten Rhodococcus jostii . Denne arten er klassifisert som følger i bakteriesystemet :

Dette betyr at innenfor arten Rhodococcus jostii er det "stammen" Rhodococcus jostii RHA1; arten Rhodococcus jostii tilhører igjen "stammen" (alias divisjon eller fylum) av actinobakterier. Eksemplet illustrerer tvetydigheten i begrepet stamme eller bakteriestamme . For å betegne rangen rett under domenet, kan man bruke flere synonymer for bakterier : Latin phylum eller division (Latin divisio , English division ).

Begrepet stamme brukes også i denne forstand for noen sopp ( gjær , mugg ). Eksempler her .

I virologi , i samsvar med reglene til den internasjonale komiteen for taxonomi av virus (ICTV) , brukes begrepet fylum generelt i stedet for avdeling eller belastning (i betydningen av en taksonomisk rang). Navneendelsene er -viricota for Phyla og -viricotina for Subphyla, Superphyla er for øyeblikket (per april 2020) ikke tillatt. I virologi er en stamme et ikke-taksonomisk navn og er alltid underlagt en art.

Individuelle bevis

  1. Ernst Haeckel: General Morphology of Organisms: generelle prinsipper for organisk vitenskap om former, mekanisk begrunnet med nedstigningsteorien reformert av Charles Darwin . G. Reimer Verlag, Berlin 1866, s. 408: Dyrrikets stammer .
  2. For eksempel Zhi-Qiang Zhang (2011): Dyrets biologiske mangfold: En oversikt over høyere nivå klassifisering og kartlegging av taksonomisk rikdom. Zootaxa 3148, s. 9-11.
  3. ^ T. Cavalier-Smith: Kingdom Protozoa and Its 18 Phyla . I: Mikrobiologiske anmeldelser . Bind 57, nr. 4, 1993, s. 953-994.
  4. Peter Ax: fylogenetisk System. Systematisering av levende natur basert på fylogenese. Gustav Fischer Verlag, 1984. ISBN 978-3-437-30450-7 .
  5. Markus Lambertz, Steven F. Perry (2015): Chordate fylogeny and the meaning of categorial ranks in modern evolutionary biology. Proceedings of the Royal Society B 282, 1807. doi: 10.1098 / rspb.2014.2327
  6. Gonzalo Giribet, Gustavo Hormiga, Gregory D. Edgecombe (2016): Betydningen av kategoriske ranger i evolusjonsbiologi. Organisms Diversity & Evolution 16 (3): s. 613-639. doi: 10.1007 / s13127-016-0263-9
  7. James W. Valentine: På Origin of Phyla . University of Chicago Press, Chicago 2004. ISBN 978-0-226-84549-4
  8. André Adoutte, Guillaume Balavoine, Nicolas Lartillot, Renaud de Rosa: evolusjon Dyr: slutten på mellomtaxa? . I: Trender i genetikk . Volum 15, utgave 3, 1999, s. 104-108.
  9. Philip Hugenholtz (2002): Exploring prokaryote mangfold i genomisk æra . Genome Biology Vol. 3, No. 2.
  10. ICTV Master Species List 2018b.v2 (MSL # 34v)