Serine proteaser
| Serine proteaser | ||
|---|---|---|
| Enzymklassifisering | ||
| EC, kategori | 3.4.21. , Peptidase | |
| Svarstype | Proteolyse | |
Serinproteaser er en underfamilie av peptidaser (dvs. enzymer som deler proteiner og peptider ).
Inndelingen i denne gruppen er knyttet til det aktive sentrum av peptidasene. Som alle enzymer har serinproteaser også en veldig spesifikk struktur i det aktive sentrum, her den katalytiske triaden . Aminosyren serin finnes der i serinproteasene .
Serinproteaser inkluderer fordøyelsesenzymer trypsin , chymotrypsin , elastase så vel som plasmin og trombin , som begge spiller en avgjørende rolle i blodkoagulering , og til slutt også granzymene som brukes av cytotoksiske T-celler for å drepe infiserte eller degenererte kroppsceller .
Katalysert reaksjon
hemning
En hemming av serinproteaser finner sted i kroppen, for eksempel av visse proteiner, slangene , for å slå av serinproteasen etter at arbeidet er utført. Mangel på disse inhibitorene fører til tromboser (eksempel antitrombin ) eller lungeemfysem (eksempel antitrypsin ). I slike tilfeller kan menneskeskapte inhibitorer som AEBSF og fenylmetylsulfonylfluorid gis .
Serinproteasene er underlagt sterkt differensiert kontroll gjennom et nettverk av samvirkende kaskader av inhiberende stoffer. To former kan skilles ut.
Uspesifikk hemning
En måte å hemme proteaser på er å legge dem i et bur. Den alfa-2-makroglobulin omgir aktivert proteaser som en musefelle. Serinproteaser som prekallikrein og trombin inaktiveres.
Spesifikk hemning
En annen form for inhibering av serinproteaser er en svært spesifikk av Serpine, en klasse av serinproteaseinhibitorer. Mange av enzymene i koagulasjonssystemet er slike serinproteaser og serinproteaseinhibitorer.
Klassifisering i henhold til UniProt / MEROPS
Den Uniprot Consortium jevnlig publiserer en liste over peptidaser som kategoriserer disse enzymene i henhold til deres utviklings opphav. Dataene i listen har informasjon av høy kvalitet og kan hentes i MEROPS- databasen. Tett beslektede molekyler er samlet i familier hvis navn består av en bokstav ('S' for serinproteaser) og et tall. Familier tilhører igjen klaner hvis familier er i slekt. Klanidentifikatorer har en bokstav i stedet for tall.
Det er 45 serineproteasefamilier i 13 klaner (fra og med 2008), med klan PA (S) med 12 familier som er av enestående betydning.
| klan | beskrivelse | Eksemplarisk enzym | UniProt | Familier |
|---|---|---|---|---|
| PA (S) | Endopeptidaser med katt. Senter His-Asp-Ser | Chymotrypsin A ( Bos taurus ) | P00766 | S1 S3 S6 S7 S29 S30 S31 S32 S39 S46 S55 S64 |
| PB (S) | Autolytiske peptidaser. Ingen peptidaseaktivitet etter autolyse. Ser på N-terminalen. | Penicillin G acylase ( E. coli ) | P06875 | S45 |
| PC (S) | Peptidaser med katt. Senter Ser-His-Glu | Dipeptidase E ( Salmonella typhimurium ) | Q1R3S5 | S51 |
| SB | Subtilase familie, endo- og exopeptidases | Subtilisin Carlsberg ( Bacillus licheniformis ) | P00780 | S8 S53 |
| SC | Endo- og exopeptidaser med katt. Senter Ser-Asp-His | Serin karboksypeptidase D ( Triticum aestivum ) | P08819 | S9 S10 S15 S28 S33 S37 |
| SE | Spesifikke peptider i metabolismen av bakterielle cellevegger | D-Ala-D-Ala-karboksypeptidase B ( Streptomyces sp ) | P15555 | S11 S12 S13 |
| SF | Endopeptidaser med katt. Center Ser-His (Lys) | UmuD-protein ( E. coli ) | P0AG11 | S24 S26 |
| SH | DNA-virus endopeptidaser med katt. Sentrer His-Ser-His | Montering (HHV-5) | P16753 | S21 |
| SJ | Endopeptidaser med katt. Senter Ser-Lys | Lon A peptidase ( E. coli ) | P0A9M0 | S16 S50 S69 |
| SK | Endopeptidaser med katt. Senter Ser-His-Asp | Peptidase Clp type 1 ( E. coli ) | Q1RF98 | S14 S41 S49 |
| SP | Autopeptidaser med katt. Senter His-X-Ser | Nukleoporin 145 ( Homo sapiens ) | P52948 | S59 |
| SQ | Aminopeptidase DmpA ( Ochrobactrum anthropi ) | S58 | ||
| SR | Endopeptidaser med katt. Senter Lys-Ser | Laktoferrin ( Homo sapiens ) | P02788 | S60 |
| SS | Amidopeptidaser med katt. Senter Ser-Glu-His | S66 | ||
| ST | Transmembrane peptidaser med transmembrane domener som substrater | S58 | ||
| S- | uten oppdrag | S48 S62 S63 S68 S71 S72 |
Viktige serinproteaser
- fordøyelsesenzymer trypsin , chymotrypsin , elastase (S1)
- prostata-spesifikt antigen og tryptaser (S1)
- den blodkoaguleringsfaktorer plasmin , trombin , jul faktor , Hageman faktor , faktor VII-aktiverende protease , kallikrein (S1) og Stuart Prower-faktor (S2)
- MBTPS1 og Proteinase K (S8)
- Dipeptidylpeptidase 4 (S9)
- granzymet som er ansvarlig for apoptosen av kroppens egne og fremmede celler