RIG-I

RIG-I
RIG-I
Representasjon basert på FBB 2QFB

Eksisterende strukturelle data : 2LWD , 2LWE , 2QFB , 2QFD , 2RMJ , 2YKG , 3LRN , 3LRR , 3NCU , 3OG8 , 3TMI , 3ZD6 , 3ZD7 , 4AY2 , 4BPB , 4NQK , 4ON9 , 4P4H

Egenskaper av humant protein
Masse / lengde primærstruktur 925 aminosyrer
Sekundær til kvartær struktur Monomer; Homomultimer etter viruskontakt
Isoformer 2
Identifikator
Genenavn DDX58 RIG-I; RIGI; RLR-1; SGMRT2
Eksterne ID-er
Enzymklassifisering
EC, kategori 3.6.1. Helicase
Svarstype Untwisting dobbeltstrenget RNA
Hendelse
Homologi familie Døde helikoptre
Parent taxon Euteleostomi
Ortolog
Mann Husmus
Entrez 23586 230073
Ensemble ENSG00000107201 ENSMUSG00000040296
UniProt O95786 Q6Q899
Refseq (mRNA) NM_014314 NM_172689
Refseq (protein) NP_055129 NP_766277
Gen locus Chr 9: 32,46 - 32,53 Mb Chr 4: 40.2 - 40.24 Mb
PubMed- søk 23586 230073

RIG-I ( retinsyreinduserbart gen I ) er en intracellulær reseptor som tilhører helikasene til det medfødte immunforsvaret hos pattedyr, som spiller en sentral rolle i gjenkjenningen av flere RNA-virus (inkludert hepatitt C , influensa ). Den naturlige liganden til RIG-I ble først identifisert i 2006. Enkelt- og dobbeltstrengede ribonukleinsyrer med et trifosfat i 5'-enden er gjenkjent. Dette trifosfat-RNA er produsert av virale polymeraser og den cellulære RNA-polymerase III.

RIG-I aktiveres av interferon-a , -β, -γ og bakterielle lipopolysakkarider . Når monomeren binder seg til trifosfat-RNA, skjer en konformasjonsendring og reseptoren multimeriserer. MAVS / IPS1- signalkaskaden utløses deretter , noe som fører til aktivering av NF-KB , IRF3 , IRF7 og frigjøring av antivirale cytokiner som interferon-β og CCR5 .

weblenker

  • A. Ablasser, F. Bauernfeind, G. Hartmann, E. Latz, KA Fitzgerald, V. Hornung: RIG-I-avhengig sensing av poly (dA: dT) gjennom induksjon av et RNA-polymerase III-transkribert RNA-mellomprodukt. I: Naturimmunologi . Volum 10, nummer 10, oktober 2009, s. 1065-1072, doi : 10.1038 / ni.1779 , PMID 19609254 , PMC 3878616 (fri fulltekst).

Individuelle bevis

  1. UniProt O95786