Grunning

I molekylærbiologi blir et oligonukleotid referert til som en primer (Pl.: Primeren; IPA : [ ˊp bezeichnetaɪ̯mɐ ]) , som fungerer som utgangspunkt for DNA- replikerende enzymer som DNA-polymerase .

DNA-polymeraser krever en hydroksygruppe som utgangspunkt for deres første koblingsreaksjon. Med deres 3'-OH-ende gir primere en passende hydroksylfunksjon. Primere kan bestå av både DNA og RNA . Under replikasjon brukes RNA som grunnmateriale i prokaryoter og eukaryoter . I prokaryoter, den primase , også kjent som DnaG protein, syntetiserer primersekvensene. I eukaryoter har DNA-polymerase α en primatfunksjon. DNA-syntese på telomerer av eukaryote celler er et spesielt tilfelle . Det polymeriserende enzymet telomerase brukes her3'-OH-enden av DNA som en primersekvens. I prokaryoter er den fremvoksende under replikasjonsprimere 5'-3 ' exonukleaseaktivitet av polymerase I eller av fjernet RNase H. I eukaryote celler blir primerne fjernet ved å forskyve DNA-syntese av polymerase δ og begrensning av klaffendonukleasen . Allelspesifikke oligonukleotider binder seg til visse SNP .

Også i in vitro - amplifisering av DNA, for eksempel i polymerasekjedereaksjon (PCR) , DNA-sekvensering eller omvendt transkripsjon , kreves primere. Det spesifikke DNA-segmentet som skal amplifiseres kan bestemmes her ved hjelp av primeren.

Grunning

Den målrettede utformingen av primere kalles primer design. For PCR-metoden bestemmes nukleotidsekvenser som flankerer DNA-segmentet som skal amplifiseres. I henhold til disse sekvensene produseres nå primersekvenser ved fosforamiditt-syntese . En primer representerer motsatt streng til sin "primer-partner". Primere for PCR-tilnærminger er vanligvis 18–30 nukleotider lange. Ulike bioteknologiselskaper tilbyr nå skreddersydde primere for molekylærbiologiske applikasjoner. Med skreddersydde mismatch primere kan spesifikke mutasjoner også introduseres i gener ved hjelp av PCR-teknikken . B. eksisterer ved utveksling av en aminosyre.

weblenker