Peplomer

SARS-CoV-2 virion med tydelig gjenkjennelige peplomerer (farget rød)

En peplomer (fra gresk πέπλος peplos “plagg, teppe”), S- glykoprotein (S for engelske pigger ) eller piggprotein er en proteinstruktur av en virushylse som stikker utover . Spike-proteiner er synlige på et elektronmikroskopbilde . De har en rolle i å binde seg til vertscellen .

begrep

I dag brukes begrepet peplomer bare for noen få virusgrupper der kappeproteinene utvikler spesielt store og karakteristiske strukturer, f.eks. B. i Orthomyxoviridae . I forhold til SARS-CoV-2- viruset blir dette erstattet av begrepet piggprotein (Spike: engelsk for “torn, stikk”). Dette antyder imidlertid en spiss struktur, noe som ikke er tilfelle med nevnte konvoluttstrukturer; de er runde, flate eller knappeformede på utsiden. Begge begrepene, peplomer og pigger, beskriver imidlertid bare en morfologisk synlig struktur og er ikke identiske med uttrykket membranprotein eller kappeprotein; mange andre membranproteiner i virus danner ikke disse fremtredende strukturer.

konstruksjon

Peplomerer består av virale membranproteiner som er forankret i lipidmembranen med et proteindomene ( transmembrandomene ). Et annet domene stikker utover og glykosyleres vanligvis gjennom feste av forskjellige sukkerrester . Dette ytre domenet til peplomeren formidler bindingen til overflate- reseptorene til målcellen og dermed innføringen av viruset i cellen. De ytre epitoper av de peplomeres definerer også de serologiske egenskaper av viruset og interaksjonen med det vertens antistoffer . En peplomer kan være sammensatt av individuelle membranproteiner eller membranproteiner som er samlet for å danne dimerer eller trimere , det er mulig for underenhetene å være identiske ( homomer ) eller forskjellige ( heteromer ). Sammensetningen av en peplomer kan presenteres på en formalisert måte, for eksempel er en enkel homodimer av to forskjellige konvoluttproteiner E1 og E2 skrevet som [E1, E2]. B. trimere, dette er formalisert: [E1, E2] 3 . En peplomer med formelen [E1, E2, E3] 2 vil representere to trimmere som består av tre forskjellige konvoluttproteiner som sammen danner en heksamer .

litteratur

  • F. Fenner et al.: The Biology of Animal Viruses, 2. utgave, New York, London 1968, ISBN 0-12-253040-3 , s. 5f
  • DJ Garwes et al.: Identifikasjon av epitoper av immunologisk betydning på peplomeren av svinoverførbar gastroenterittvirus . Adv Exp Med Biol. (1987) 218: s. 509-515, PMID 2449047
  • HG Niesters et al.: Peplomer-proteinsekvensen til M41-stammen av coronavirus IBV og dens sammenligning med Beaudette-stammer . Virus Res. (1986) 5 (2-3): s. 253-263, PMID 2429473

Individuelle bevis

  1. SARS-CoV-2: Grunnleggende virologiske data og virusvarianter. (Per 11. desember 2020). På: Nettstedet til Robert Koch Institute: [1] . Robert Koch Institute , 25. januar 2021, åpnet 7. februar 2021 (se f.eks. Avsnitt 2).