PB1

PB1
andre navn
  • Polymerase basisk protein 1 (influensavirus A)
  • RNA-rettet RNA-polymerase katalytisk underenhet

Eksisterende strukturelle data : PDB  2ZNL , PDB  2ZTT , PDB  3A1G

Masse / lengde primærstruktur 757 aminosyrer , 86 576 Da
Identifikator
Eksterne ID-er
Enzymklassifisering
EC, kategori 2.7.7.48
Ortolog
Influensavirus A / PuertoRico / 8/1934 (H1N1) Influensavirus A / California / 07/2009 (H1N1)
Entrez 956534 23308122
UniProt P03431 C3W5X7
Refseq (protein) NP_040985.1
PubMed- søk 956534 23308122

PB1 er et av opptil elleve forskjellige proteiner av influensavirus A (IAV).

kjennetegn

PB1 er et internt protein i IAV og forekommer i virionen . Det er et av de tre virale proteinene i RNA-polymerasekomplekset ved siden av PA og PB2 . Foruten PB2 er PB1 et polymeraseprotein med et grunnleggende isoelektrisk punkt , mens PA har et surt isoelektrisk punkt. Derav forkortelsen av navnet.

Noen ganger dannes et ikke-essensielt protein PB1-F2 fra en annen åpen leseramme . RNA-polymerasekomplekset er i replikasjonssyklusen for replikasjon og transkripsjon av viralt RNA som er ansvarlig. Det virale mRNA transkriberes ved hjelp av den unike mekanismen for låsing av hetter . Det cellulære mRNA modifisert med 5'-metylerte cap-strukturer er bundet av PB2 til 7-metylguanosin-gruppen og deretter kuttet av PA 10 til 13 nukleotider i henhold til cap-strukturen . De korte hettebærende fragmentene er bundet av PB1 og brukt i RNA-polymerasekomplekset som primere for transkripsjon av viralt RNA. Under replikering initierer PB1 RNA-syntese. PB1 er fosforylert .

applikasjoner

PB1 blir studert som et mål i medisinutvikling mot IAV.

weblenker

Individuelle bevis

  1. Hill MR Hilleman : Virkeligheter og gåter av human virusinfluensa: patogenese, epidemiologi og kontroll. I: Vaksine bind 20, 2002, nr. 25-26, s. 3068-3087, PMID 12163258 .
  2. ^ RP Kamal, IV Alymova, IA York: Evolution and Virulence of Influenza A Virus Protein PB1-F2. I: International journal of molecular sciences. Volum 19, nummer 1, desember 2017, s., Doi : 10.3390 / ijms19010096 , PMID 29286299 , PMC 5796046 (fri fulltekst).
  3. ↑ S. Massari, L. Goracci, J. Desantis, O. Tabarrini: Polymerase Surt Protein-Basic Protein 1 (PA-PB1) Protein-Protein Interaction som et mål for neste generasjon anti-influensa Therapeutics. I: Journal of medicinal chemistry. Volum 59, nummer 17, september 2016, s. 7699-7718, doi : 10.1021 / acs.jmedchem.5b01474 , PMID 27046062 .