Enterobacteriaceae

Enterobacteriaceae
Escherichia coli (sekundært elektronmikroskopbilde, deretter farget)
Systematikk
Domene : Bakterier (bakterier) Avdeling : Proteobakterier Klasse : Gammaproteobakterier Bestilling : Enterobakterier (Enterobacterales) Familie : Enterobacteriaceae
Vitenskapelig navn
Enterobacteriaceae
Rahn emend i 1937 . Adeolu et al. 2016

Den Enterobacteriaceae er en stor gruppe av gram-negative bakterier . I henhold til fylogenetisk system , de tilhører den rekkefølgen av Enterobacterales i den klasse av Gammaproteobacteria i divisjon ( Divisio , også kjent som rekken hos prokaryoter ) Proteobacteria og danne sin egen familie der . Navnet Enterobacteriaceae er avledet fra enteron ( gammelgresk ἕντερον 'tarm'), fordi mange av dem er typiske Er tarmboere . Imidlertid tilhører mange frilevende og allestedsnærværende , ikke-kolon-levende bakteriearter også denne familien.

Fram til 2016 var Enterobacteriaceae den eneste familien i rekkefølgen "Enterobacteriales", men navnet på denne ordren var ikke gyldig i henhold til reglene i den bakteriologiske koden (ICBN). I 2016 førte fylogenetiske metoder til etablering av ordren Enterobacterales (Enterobacteria), kombinert med en inndeling av de tidligere kjente taxaene i flere nye familier. Det nye systemet betyr at færre slekter tilhører Enterobacteriaceae- familien og at kjente slekter fra samme orden som Yersinia , Proteus eller Hafnia tilhører andre familier (se avsnitt Systematikk og taksonomi ).

funksjoner

Utseende

De celler som er stavformet og vanligvis 1 til 5,  um lange og omtrent 0,5 til 1,0 mikrometer i diameter. Ingen endosporer dannes. De fleste av dem kan bevege seg aktivt med flagella , de er bevegelige , men det er også arter som ikke kan bevege seg aktivt, f.eks. B. Klebsiella og Raoultella . Siden celleveggen består av noen få mureinlag og en andre, ytre membran av fosfolipider og lipopolysakkarider , er Enterobacteriaceae gramnegative .

metabolisme

Raoultella planticola i SIM-agar med negativt resultat for H ₂ S-dannelse, med negativt resultat for indolprøven og med et negativt resultat for motilitet

Deres metabolisme er fakultativt anaerob , slik at de kan bryte ned stoffer via oksidasjon i nærvær av oksygen og gjære under anoksiske forhold (uten oksygen) . I Enterobacteriaceae er katalasetesten positiv og oksidasetesten er negativ. To viktige anaerobe metabolske veier som brukes til å skille mellom de enkelte artene er 2,3-butandiolfermentering og blandet syrefermentering ( blandet syrefermentering ). I blandet syrefermentering er sluttproduktene og biproduktene hovedsakelig syrer som eddiksyre , melkesyre og ravsyre (suksinat), men ingen butandiol . Ved gjæring av 2,3-butandiol resulterer gjæringen av glukose i mindre mengder syrer som sluttprodukter og biprodukter, men fremfor alt i store mengder alkoholen 2,3-butandiol . Et annet trekk ved 2,3-butandiol-gjæring er mellomproduktet acetoin og den mye høyere gassproduksjonen ( CO ₂ ). Man finner butandiol gjæring z. B. Enterobacter og Klebsiella . Bruk blandet syregjæring blant annet. Generasjoner som Citrobacter , Escherichia , Salmonella og Shigella .

Et stort antall biokjemiske diagnostiske tester brukes til å bestemme de enkelte slektene . For eksempel blir mellomproduktet acetoin av 2,3-butandiolfermentering påvist ved hjelp av Voges-Proskauer-testen . Denne reaksjonen er en del av den såkalte IMViC testprosedyren for å skille Escherichia fra andre Enterobacteriaceae. Siden fargede reaksjonsprodukter ofte produseres i testprosedyren eller pH-indikatorer med fargeendring brukes, blir de i laboratoriet referert til som den fargerike serien . Påvisning av enzymet β-galaktosidase brukes også ofte til å skille representantene for Enterobacteriaceae. Bakterier som har dette enzymet kan splitte disakkaridet laktose (melkesukker) hydrolytisk i monosakkaridene glukose og galaktose for å bruke dem i stoffskiftet.

Fylogenetikk

→ Se også: Seksjon Systematikk og taksonomi i artikkelen i rekkefølgen Enterobacterales

Ved å bruke fylogenetiske metoder kan stammehistorien og forholdet mellom bakteriene avklares. I beskrivelsen av ordren Enterobacterales Adeolu et al. I 2016 og familiene som tilhører det, danner Enterobacteriaceae en monofyletisk gruppe i et fylogenetisk tre (basert på genom og genetiske analyser ) . Videre, 21, konserverte karakteristiske indels (Engl. ' Conserved signature inserts and deletions CSI) sett, som er typiske for representanter for familien, men forekommer ikke i de andre bakteriene i ordenen.

Hendelse

Mange Enterobacteriaceae er en del av den sunne tarmfloraen hos mennesker og dyr; imidlertid forekommer de også overalt i miljøet (jord, vann). Noen er patogener hos mennesker og dyr. De forekommer ofte som nosokomiale patogener ("sykehusbakterier") og angriper mennesker med et svakt immunsystem . Sannsynligvis det viktigste medlemmet av familien er Escherichia coli , en av de viktigste modellorganismer innen genetikk , biokjemi og mikrobiologi .

Systematikk og taksonomi

Eksternt system

Rekkefølgen av Enterobacterales etablert i 2016 inkluderer åtte familier (inkludert Hafniaceae , Morganellaceae og Yersiniaceae ) med totalt ca 60 slekter. Den nyetablerte typen av ordren, som tilsvarer reglene for den bakteriologiske koden (ICBN), er slekten Enterobacter .

Internt system

Lett mikroskopisk bilde av Citrobacter freundii etter Gram-farging

Familiens type slekt er slekten Escherichia , mens slekten Enterobacter ble etablert som typen slekten i rekkefølgen Enterobacterales. Følgende slekter tilhører familien Enterobacteriaceae (fra og med 2019):

Kolonier av Cronobacter sakazakii på et næringsmedium

Kolonier av Salmonella på XLD agar med positive resultater for H ₂ S formasjon

• Biostraticola Verbarg et al. 2008
• Buttiauxella Ferragut et al. 1982
• Cedecea Grimont et al. 1981
• Citrobacter Werkman og Gillen 1932
• Cronobacter Iversen et al. 2008
• Enterobacillus Patil et al. 2015
• Enterobacter Hormaeche og Edwards 1960 dukker opp. Brady et al. 2013
• Escherichia Castellani og Chalmers 1919, slekt av familien
• Franconibacter Stephan et al. 2014
• Gibbsiella Brady et al. 2011 emend. Kim et al. 2013
• Izhakiella Aizenberg -Gershtein et al. 2016
• Klebsiella Trevisan 1885 (godkjente lister 1980) emend. Drancourt, et al. 2001
• Kluyvera Farmer, et al. 1981
• Leclercia Tamura, et al. 1987
• Mangrovibacter Rameshkumar et al. 2010
• Metakosakonia Alnajar og Gupta 2017
• Plesiomonas corrig. Habs og Schubert 1962
• Pseudescherichia Alnajar og Gupta 2017
• Raoultella Drancourt, et al. 2001
• Saccharobacter Yaping et al. 1990
• Salmonella Lignieres 1900
• Shigella Castellani og Chalmers 1919
• Shimwellia Priest og Barker 2010
• Thorsellia fighters et al. 2006
• Trabulsiella McWhorter et al. 1992
• Yokenella Kosako, et al. 1985

Synonymer og ikke pålitelig tildelt taxa

Alle arter fra Levinea Young et al. I 1971 ble Werkman og Gillen lagt til slekten Citrobacter i 1932. Arten Calymmatobacterium granulomatis ble omklassifisert som Klebsiella granulomatis i 1999 .

"Atlantibacter", "Edaphovirga", "Kosakonia", "Lelliottia", "Limnobaculum", "Pluralibacter", "Pseudocitrobacter", "Rosenbergiella", "Siccibacter" og "Superficieibacter" er andre slekter hvis navn ikke (ennå) er tilgjengelige er anerkjent i henhold til reglene i den bakteriologiske koden (ICBN) (fra og med 2019) og som det mistenkes at de er en del av familien. Det er også andre slekter eller arter med status Candidatus som kan betraktes som tilhørende familien. Disse er for eksempel " Candidatus Arocatia carayoni", " Candidatus Ishikawaella capsulata" og " Candidatus Schneideria nysicola".

etymologi

Navnet på slekten Enterobacter Hormaeche og Edwards 1960 er avledet fra enteron ( gammelgresk ἕντερον 'tarm') og det latiniserte ordet bakter for gammelgresk βακτηρΐα 'stang', betyr følgelig noe sånt som "liten stavbakterie i tarmen". Navnet på Enterobacteriaceae Rahn 1937-familien inneholder de samme ordstammene, men opprinnelsen til navnet har ikke blitt overført med sikkerhet av Rahn som den første personen som beskriver det. På tidspunktet for beskrivelsen ble bakteriene av slekten Enterobacter ennå ikke kalt dette navnet. I den første utgaven av Bergey's Manual of Systematic Bacteriology fra 1984 presenteres etymologien som følger: Det latiniserte ordet enterobacterium betyr 'tarmbakterie', med den typiske enden -aceae for å identifisere en familie, navnet Enterobacteriaceae betyr "familie av tarmbakterier ”. Denne avledningen vil forklare hvorfor navnet er Enterobacteriaceae (med et ekstra "i") og ikke Enterobacteraceae.

Rapporteringskrav

I Sveits er det positive laboratorium analytiske funn carbapenemase visuell Enterobacteriaceae rapporteringskrav for leger, sykehus, etc. eller laboratorier nemlig etter loven Epidemier (EPG) i forbindelse med epidemien forskrift og vedlegg 1 og vedlegg 3 i forskrift av EDI på rapportering av observasjoner overførbare sykdommer hos mennesker .

Se også

• Enterobacteriophage PhiX174
• Enterobacteriophage Lambda

hovne opp

litteratur

• Volum 6: Proteobakterier: Gamma-underklasse . I: Martin Dworkin , Stanley Falkow , Eugene Rosenberg , Karl-Heinz Schleifer , Erko Stackebrandt (red.): Prokaryoter. En håndbok om biologi av bakterier . 3. Utgave. Springer-Verlag, New York 2006, ISBN 978-0-387-25496-8 , doi : 10.1007 / 0-387-30746-X_9 . 
• Don J. Brenner , JJ Farmer III: Family I. Enterobacteriaceae . I: George M. Garrity , Don J. Brenner, Noel R. Krieg, James T. Staley (red.): Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: Volume 2: The Proteobacteria, Part B: The Gammaproteobacteria . 2. utgave. Springer-Verlag, New York 2005, ISBN 978-0-387-95040-2 , pp. 587-607 . 
• Michael T. Madigan, John M. Martinko, Jack Parker: Brock - Mikrobiologie , Spektrum Akademischer Verlag , Heidelberg, Berlin 2001, ISBN 3-8274-0566-1

Individuelle bevis

1. ↑ ^{a b c d e} M. Adeolu, S. Alnajar, S. Naushad, RS Gupta: Genombasert fylogeni og taksonomi til 'Enterobacteriales': forslag til Enterobacterales ord. nov. delt inn i familiene Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., og Budviciaceae fam. nov. I: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Nei. 66 , desember 2016, s. 5575-5599 , doi : 10.1099 / ijsem.0.001485 . 
2. ↑ ^{a b} Michael T. Madigan, John M. Martinko, Jack Parker: Brock Mikrobiologie. Tysk oversettelse redigert av Werner Goebel, 1. utgave. Spektrum Akademischer Verlag GmbH, Heidelberg / Berlin 2000, ISBN 3-8274-0566-1 , s. 531-536.
3. ^ ^{A b} Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Klassifisering av domener og phyla - Hierarkisk klassifisering av prokaryoter (bakterier). I: Liste over prokaryote navn med stående i nomenklatur (LPSN). Hentet 21. desember 2019 . 
4. ↑ Taksonomi-nettleser Enterobacteriaceae. I: Nettstedet for National Center for Biotechnology Information (NCBI). Hentet 21. desember 2019 . 
5. ↑ E. Hormaeche, PR Edwards: En foreslått slekt Enterobacter. I: International Bulletin of Bacteriological Nomenclature and Taxonomy. Bind 10, nr. 2, april 1960, s. 71-74. ISSN  0096-266X . doi : 10.1099 / 0096266X-10-2-71 .
6. ^ Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Slekten Enterobacter. I: Liste over prokaryote navn med stående i nomenklatur, systematikk av bakterier (LPSN) . Hentet 21. desember 2019 . 
7. ^ Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Familiy Enterobacteriaceae. I: Liste over prokaryote navn med stående i nomenklatur, systematikk av bakterier (LPSN) . Hentet 21. desember 2019 . 

weblenker