AlphaFold

AlphaFold er et program som maskinlæring bruker en proteinstruktur basert på aminosyresekvensen for å forutsi proteinet.

Eksempel på bretting og struktur av 1EFN-proteinet. Inngang for AlphaFold vil være aminosyresekvensen (primær struktur), mens utgangen vil være den tilsvarende tredimensjonale sekundære og tertiære strukturen.

Programmet ble utviklet av det London-baserte selskapet Deepmind og oppnådde toppkarakterer i Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP) konkurransen i 2018 og 2020. Dette ble mottatt i media som et gjennombrudd i prediksjon av proteinstruktur. Siden 15. juli 2021 har programvaren vært underlagt en åpen kildekode-lisens - også for kommersielle selskaper. I tillegg ble funksjonaliteten publisert i Nature.

Individuelle bevis

  1. ↑ AlphaFold . I: Deepmind . Tilgang 30. november 2020.
  2. Wen Ewen Callaway: 'Det vil forandre alt': DeepMinds AI gjør et gigantisk sprang i å løse proteinstrukturer. I: Natur. 588, 2020, s. 203, doi : 10.1038 / d41586-020-03348-4 .
  3. ^ Robert F. Service: 'Spillet har endret seg.' AI triumferer ved å løse proteinstrukturer. I: sciencemag.org. 1. desember 2020, åpnet 24. desember 2020 .
  4. ↑ Sam Shead: DeepMind løser 50 år gamle 'store utfordring' med proteinfolding AI I: CNBC . 30. november 2020, åpnet 18. desember 2020 .
  5. ↑ Jumper, J., Evans, R., Pritzel, A. et al. Svært nøyaktig proteinstrukturforutsigelse med AlphaFold. . I: Natur . 2021. Tilgang 19. juli 2021.